海豚链球菌LAMP方法的建立及初步应用

海豚链球菌LAMP方法的建立及初步应用张永德冯世文李军摘要:为快速准确地检测鱼类海豚链球菌(Streptococcusiniae),减少由其造成的经济损失,建立了一种基于Sim基因高效、敏感的海豚链球菌环介导等温扩增(LAMP)检测技术,并对739個样品进行了检测。结果表明,该方法可以特异性地检测海豚链球菌,而不能检测无乳链球菌(Streptococcusagalactiae)、副乳房链球菌(Streptococcusparauberis)、停乳链球菌(Streptococcusdysgalactiae)等8种参考菌株。对海豚链球菌DNA最低检测限为5.32拷贝/μL;对739个样品的检测结果显示,8种鱼类海豚链球菌的平均检出率为17.67%,池塘水和海水的检出率分别为13.33%、16.67%;该菌主要发现于罗非鱼脑组织中,其平均检出率为27.04%(43/159),而其他鱼类则主要发现于皮肤,平均检出率为24.14%(42/174);阳性样品主要来自于2014年6月至9月期间,占总检出率的65.00%。关键词:海豚链球菌(Streptococcusiniae);链球菌病;环介导等温扩增技术;罗非鱼:S852.61:A:0439-8114(2018)15-0099-06DOI:10.14088/jki.issn0439-8114.2018.15.025开放科学(资源服务)标识码(OSID):DevelopmentandPreliminaryApplicationofLoop-mediatedIsothermalAmplification(LAMP)MethodforRapidDetectionofStreptococcusiniaeZHANGYong-de1,FENGShi-wen2,LIJun2,PENGHao2,LIANGWan-wen1,YUYan-ling1,LIMing1,YANGXue-ming1,ZHU激a-激e1,LUOHong-lin1,CHENFu-yan1,LEIAi-ying1(1.GuangxiKeyLaboratoryforAquaticGeneticBreedingandHealthyAquaculture/GuangxiAcademyofFisherySciences,Nanning530021,China;2.GuangxiVeterinaryResearchInstitute/GuangxiKeyLaboratoryofVeterinaryBiotechnology,Nanning530001,China)Abstract:TodeveloparapidandaccuratemethodfordetectingStreptococcusiniaeandlimitthelossesbecauseofthisdisease,aloop-mediatedisothermalamplification(LAMP)assaywasestablishedwithfourspecificprimersdesignedaccordingtotheSimgeneofStreptococcusiniaeinGenBank,andtotally739sampleswerecollectedanddetectedbyLAMP.TheresultsshowedthattheLAMPhadahighsensitivityforS.iniaewithdetectionlimitsof5.32copies/μLS.iniaeDNA.TheLAMPmethodhadastrongspecificity,whichcanbespecificallyamplifiedS.iniae,andnoamplificationswereobservedinthe8referencestrains.Thedetectionresultsof739samplesshowedthattheaveragedetectionrateofS.iniaeinthesamplesfrom8speciesofculturedfishwas17.67%,while13.33%and16.67%werefrompondwaterandseawater,respectively.Thebacteriawerefoundmainlyintilapiabraintissues,andtheaveragepositivedetectionratewas27.04%,whileinotherfishes,theaveragepositivedetectionratewas24.14%.HigherS.iniaepositivecarryingrateduringJuntoSep,2014wasfoundcomparingtoJantoMayandOcttoDec,2014,withthedetectionratereachedto65.00%.Keywords:Streptococcusiniae;streptococcosis;loop-mediatedisothermalamplification(LAMP);tilapia链球菌病是一种细菌性疾病,对多种鱼类如亚洲石斑鱼、鲈鱼、银鲳、日本比目鱼、红鼓鱼和罗非鱼等造成严重的影响[1-3]。据估计,全球鱼类每年由链球菌造成的经济损失约2.5亿美元。目前,发现可引起鱼类链球菌病的链球菌亚种主要有无乳链球菌(Streptococcusagalactiae)、海豚链球菌(Streptococcusiniae)、副乳房链球菌(Streptococcusparauberis)和停乳链球菌(Streptococcusdysgalactiae),其中,海豚链球菌和无乳链球菌已成为鱼类,特别是罗非鱼链球菌病的主要病原[4-6]。在中国,2001—2006年罗非鱼链球菌病只是个别养殖场偶发,累计死亡率只有5%~15%。然而从2009年开始,罗非鱼链球菌病大规模爆发,并伴随30%~80%的高死亡率,仅2011年造成的经济损失就高达约4亿美元。尽管海豚链球菌和无乳链球菌都可引起罗非鱼链球菌病,但其优势菌群可能在不同的时期会改变。Chen等[7]发现,中国2006和2007年流行的主要菌...

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