忍冬干叶基因组DNA提取方法探究

忍冬干叶基因组DNA提取方法探究摘要:目的:从变色硅胶干燥的忍冬叶片中提取高质量的基因组DNA。方法:分别采用常规CTAB法与改良CTAB法提取干叶的DNA,通过琼脂糖凝胶电泳、紫外分光光度法、酶切检测其质量,并与鲜叶的提取效果比较。结果:改良CTAB法所得DNA优于常规CTAB法,电泳条带清晰,完整性好,纯度高,能被EcoRl完全酶切。从变色硅胶干燥的忍冬叶片中提取的DNA质量与鲜叶无明显差异,且产率更高。结论:改良CTAB法适合忍冬干叶基因组DNA的提取。关键词:忍冬干叶;DNA提取;改良CTAB法中图分类号:R282文献标识码:A文章编号:1673-7717(2008)03-0496-03AStudyonMethodsforExtractionofGenomicDNAfromLoniceraJaponicaThunb・DryLeavesWANGTingl,ZHOUFeng-qinl,LIJial,ZHANGYong-qingl,GUOQing-meil,XIAYang2,LIYan-yan2,YANLi-ping2(1.CollegeofPharmacy,ShandongUniversityofChineseMedicine,Jinem250014,Shandong,China;2.ShandongAcademyofForestryScience,Jinan---本文来源于网络,仅供参考,勿照抄,如有侵权请联系删除---250014,Shandong,China)AbstTact:Objective:ToextracthighqualitygenomicDNAfromLoniceraJaponicaThunb.drybudswithsilicagel.Methods:Twodifferentmethods,conventionalCTABmethodandmodifiedCTABmethod,wereappliedtoisolategenomicDNAfromdryleavesofLoniceraJaponicaThunb.TheDNAobtainedwasanalyzedbythemeansofagarosegelelectrophoresis,ultravioletspectrophotometricmethodandenzymaticdigestion.Results:HigherpurityDNAwasobtainedbymodifiedCTABmethodanditcanbedigestedbyrestrietionenzymeEcoRIcompletely.TheDNAextractedfromdrybudshadnoobviousdifferenceswiththeDNAfromfreshbudsinqualityandgothigheryield・Conclusion:ThemodifiedCTABmethodwassuitablefortheextractionofgenomicDNAfromLoniceraJaponicaThunb.dryleaves・Keywords:LoniceraJaponicaThunb.dryleaves;DNAextraction;modifiedCTABmethod金银花为忍冬科植物忍冬LoniceraJaponicaThunb.的干燥花蕾或带初开的花[1]。山东是金银花的重要道地产区,长期的自然选择与人工选择,忍冬的种质发生了明显的---本文来源于网络,仅供参考,勿照抄,如有侵权请联系删除---变异与分化,形成了很多农家品种或品系[2]。为了综合评价忍冬的种质资源,有必要在分子水平上对其遗传多样性进行分析,而基因组DNA的成功抽提是进行任何分子生物学研究的前提。常用的植物DNA提取材料是新鲜幼嫩叶片,然而受取样时间、交通运输条件等的限制,鲜叶往往得不到较好的保存,严重影响了所提DNA质量和下游操作。文献报道[3-6]用变色硅胶快速干燥法保存的材料提取DNA效果较好,且采样方便,样品可长期保存。因此,笔者在进行忍冬种质评价的AFLP分析时,以变色硅胶干燥叶片为材料,进行基因组DNA提取方法的研究,摸索出了适合忍冬干叶的DNA提取方法,从而为后续的采样工作和DNA模板的制备奠定了良好的基础。1材料与方法1.1材料1.1.1实验材料于2006年10月取自山东平邑,经山东中医药大学周凤琴教授鉴定为忍冬科植物忍冬LoniceraJaponicaThunb.o取新鲜完整叶片按文献[7]方法用变色硅胶脱水干燥,同时取枝条抒插,用其萌发的幼叶作对照。1.1.2试剂琼脂糖(Biowest);CTAB(Sangon);EDTA、Tris(济南朋远生物技术有限公司);B-硫基乙醇(济南爱博经贸有限公司);PVP-40(北京欣经科生物技术公司);EcoRI,DNAMarkerDL2000,X-Hindllldigest---本文来源于网络,仅供参考,勿照抄,如有侵权请联系删除---(TaKaRa);其余试剂均为国产分析纯。STE核分离缓冲液:100mmol/LTris-HCl(pH8.0),50mmol/LEDTA(pH8.0),700mmol/LNaCl,2%PVP(w/v),2%B-蔬基乙醇(v/v)o2XCTAB提取缓冲液:2%(w/v)CTAB,100mmol/LTris-HCl(pH&0),20mmol/LEDTA(pH8.0),1.4mol/LNaCl,5%PVP(w/v),2%-蔬基乙醇(v/v)o10%CTAB溶液:10%(w/v)CTAB,0.7mol/LNaCloTE缓冲液:10mmol/LTris-HCl(pH8.0),lmmol/LEDTA(pH8.0)。1.1.3仪器Allegra^TM21RCentrifuge高速冷冻离心机(BECKMANCOU...

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