分子机制研究套路（二）蛋白翻译后修饰-泛素化课题：蛋白A调节蛋白B泛素化和降解的研究1．概念介绍：大多数蛋白均需进行翻译后修饰来扩增蛋白质组的数量，调节蛋白质的稳定性、分布和功能。翻译后修饰包括磷酸化、泛素化、亚硝基化、氧化等等。泛素化是在蛋白质翻译后,通过将泛素分子结合到靶蛋白上,形成多聚泛素链,带有多聚泛素链的靶蛋白可被26S蛋白酶体识别、降解。泛素是76个氨基酸的多肽片段，包含7个赖氨酸残基，允许同时发生聚泛素化反应。在赖氨酸-48聚泛素化会导致其通过28S蛋白酶体降解。然而赖氨酸-63可以改变细胞的功能，包括运输和DNA修复。可见，单一的泛素化会依据其作用位点的不同而产生不同的结果。它和泛素激活酶（E1）、泛素结合酶（E2）、泛素连接酶（E3）和蛋白酶体组成了泛素-蛋白酶体系统（Ubiquitin-ProteasomeSystem，UPS）。UPS是细胞内非溶酶体途径蛋白质降解通路，不仅降解变性、异常或起短暂作用的蛋白质，而且能降解转录因子、内膜蛋白和细胞周期蛋白等天然蛋白，对于维持蛋白质稳定状态、调节细胞程序性死亡和控制细胞周期等过程有重要的作用。UPS还可作用于转录因子及体内的某些信号传导通路，并参与细胞凋亡、主要组织相容性复合体抗原递呈、细胞周期以及细胞内信号传导等多个细胞生理活动，对维持细胞正常生理功能具有重要意义。2．示意图：图1UPS的发生依赖于三种酶的参与。E1通过硫酯键将E1酶半胱氨酸与泛素分子连接在一起，其能量于ATP水解作用；E2与泛素蛋白连接于激活的半胱氨酸位点；E3负责将泛素化蛋白与靶蛋白结合在一起，3．研究思路：3.1蛋白A降低蛋白B的表达量...................................................................................33.1.1蛋白A介导蛋白B降解........................................................................................33.1.2蛋白A降解蛋白B的特异性...............................................................................33.1.3蛋白A介导蛋白B降解呈剂量依赖性...............................................................33.1.4蛋白A调节蛋白B稳定性....................................................................................43.2蛋白A介导蛋白B降解位于蛋白酶体系统..........................................................43.2.2蛋白B降解位于蛋白酶体系统............................................................................43.2.3蛋白A介导蛋白B降解位于蛋白酶体系统.......................................................53.3赖氨酸XXX位点为蛋白A介导蛋白B泛素化靶位点........................................53.3.1蛋白A介导蛋白B泛素化....................................................................................53.3.2赖氨酸XXX位点为蛋白A介导蛋白B泛素化靶位点............................................53.4蛋白A氨基端与羧基端在蛋白B降解中的作用..................................................63.4.1蛋白A氨基端与蛋白B降解...............................................................................63.4.2蛋白A羧基端与蛋白B降解...............................................................................63.4.3蛋白A羧基端与蛋白B泛素化...........................................................................63.1蛋白A降低蛋白B的表达量3.1.1蛋白A介导蛋白B降解蛋白A是泛素蛋白酶体系统中的一个调节分子。前期研究结果显示，蛋白A可以调节蛋白B所在家族的某些分子的的泛素化和降解。为探讨蛋白A对于蛋白B的调节方式，构建质粒蛋白A-V5和蛋白A-HA，并将两种质粒分别转染HEK293细胞48小时后，收集细胞，采用Westernblot方法检测其蛋白表达水平，结果如图3.1显示，两种质粒转染HEK293后，均可以下调HEK293细胞中内源性的蛋白B的表达。3.1.2蛋白A降解蛋白B的特异性为探讨蛋白A介导蛋白B降解的特异性，我们将其他三种蛋白A的家族蛋白X、Y、Z转染HEK293细胞48小时，采...