生命科学中计算机应用的典型类型

生命科学中计算机应用的典型类型【摘要】笔者通过研读大量文献,将计算机应用在生命科学的典型类型进行论述,以期对于生命科学专业的教师在以后的研究或教学示范有一定帮助。【关键词】计算机生命科学典型类型【中图分类号】G642【文献标识码】A【文章编号】1674-4810(2014)07-0066-01一数据采集和处理1.计算机在生命科学领域数据采集中的应用根据在线检测,如正常的温度、压力实验效果、代谢中间物质的检测、生物种群数目的统计等,这些数据采集数量大涉及面积广,如果靠人工采集,投入量大,而且不符合需要。传统方法、在线监测数据的技术不成熟,在线监测很难实现。新型数据传感器的研发并成功应用,满足了生命科学数据采集需要。新型数据传感器利用监测光、电、热、辐射量等可以定量的物质、生物物质和酶等分子之间作用与光、热等物理量存在定量的数学关系。根据这些基本原理,我们研发出特殊用途的电极和监测系统,如细胞电极、酶电极和分子电极,这些电极有很多优点,满足信息采集的需要,物电信号转换快、灵敏度高、测量误差小,尤其是大量的数据采集仪器,如色谱法、质谱法的应用生物传感器和生化测定仪器,其中核磁共振仪是特别重要的。2.计算机对生命科学实验数据的处理数据处理包括处理、建立和求解各种生命科学实验数据的学习生活方面的数学模型,用于控制和监测的实验使用的数学模型,实验跟踪生物量、生物参数以及生命科学和生物工程,包括优化的实验设计。如果测定DNA序列中核苷酸的位置,需要处理和收集DNA光谱数据;生物分子应用放射性物质跟踪,从而研究生物分子的发展变化;利用计算机设计模拟技术来优化生物工厂的建筑设计,自动分析和测量值的实验误差的处理基因芯片技术是基因,基因研究须采用计算机对采集的数据进行高效分析,从中获得研究基因的众多信息,再仔细处理从而得到相应结果。在所有数据处理和数据分析研究,计算机的应用和构建生命科学意义上的数学模型是非常重要的,和生命科学研究的数学模型一样,处于逐步从静态到动态的发展中。二计算机在生命科学中的应用1.计算机在生物信息学中的应用蛋白质三维结构需要通过计算机辅助方法进行预判,预测过程中我们需要对核酸和蛋白质等物质三维结构进行精确测量,这种技术被用于生物大分子药物设计,已成为当今社会的热点。世界人类基因课题组计划所测定的30亿个碱基中,人类3万个基因需要分析和核苷酸定位,进而弄清楚其中所有功能单位的组织结构形式以及调节机制,没有计算机的帮助是难以想象的。近年来,基因组学、蛋白质组学、代谢组学的快速发展,迫切需要开发新的数据分析技术和计算机软件快速访问所需的数据和信息。生物信息研究除了可以提供基因结构信息,还可以为蛋白质和其他物质提供空间结构信息和电子结构信息。2.计算机数值方法在生命科学中的应用现代生物信息学中的数学模型是一个非常复杂的模型,涉及知识广泛,而且需要很多方程耦合,比较常用的是非线性代数和微分方程耦合分析。为了研究这种复杂的数学模型,必须使用计算机数值方法。因此,通过求解计算机数值分析方法的实际问题,已成为一个重要的方法。只要数值方法的选择、使用或计算机程序合理,就可以利用计算机解决数学模型的研究和计算实际问题。由于数值计算方法的发展提出了许多实际问题,计算机数值模拟软件已经在大量开发。设计的子程序用于解决实际计算问题时,应用者需要掌握数值处理方法的知识和应用能力。因为当使用任何复杂和完善的程序来解决特定的问题都可能会遇到各种问题,这些困难可能是由于某种原因造成的:数学模型并不能精确反映实际情况,用数值方法精确描述生命科学的实际过程是不合适的。这是由于该方法的误差超过科学研究允许的实际误差,从而反映出的结果和实际有很大差距。子程序的使用条件下实际的选择不是在解决具体工程问题,子程序未能适当地修改或调整。事实上,在应用或使用任何子程序的时候,需要根据实际问题的用户的发展。作为子程序的最佳解决具体计算问题的选择上,需要更加厚实的基础知识,尤其是数值计算方法。因此生命科学科技实验人员或教学工作者总结掌握数值方法是非常重要的。三结...

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