20份野生狗牙根srap体系优化及多态性的分析

...20份新疆野生狗牙根SRAP体系优化及多态性分析张延辉,阿不来提,李培英,张艳霞(新疆草地资源与生态自治区重点实验室,新疆农业大学草业与环境科学学院,新疆乌鲁木齐830052)摘要:通过探讨狗牙根SRAP反应体系中主要因子对扩增结果的影响,建立了狗牙根SRAP-PCR反应的最适宜体系:在10ul的反应体系中,1.4μL10×Buffer,dNTP浓度为0.2mmol/L,TaqDNA聚合酶0.2U及DNA模板为20ng。利用SRAP标记技术对新疆20份野生狗牙根材料的遗传多样性进行研究。结果表明:供试材料野生狗牙根具有较为丰富的遗传多样性;各生态地理类群间的遗传分化与其所处的生态地理环境具有一定的相关性。关键词:狗牙根;SRAP;聚类分析TheSRAPSystemOptimizationandPolymorphismAnalysisof20WildCynodondactylonfromXinjiangZhangYanhui,Abulti,Lipeiying,Zhangyanxia(XinjiangKeyLaboratoryofGrasslandResourcesandEcology,DepartmentofGrasslandandEnvironmentScience,XinjiangAgricultureUniversity,Urumqi,830052)Abstract:AnoptimumSRAP-PCRsystemwasestablishedbyStudyingtheeffectiononthemajorelementsofSRAPreactionsystemofCynodondactylon,Theresultsshowedthatthebestconcentrationwas1.4μL10×Buffer,0.2mmol/LdNTP,0.2UTaqDNAenzyme,templateDNA20ng/μL,primer25ng/μLin20μLreactionsystem.Sequence-relatedamplifiedpolymorphism(SRAP)molecularmarkerswereusedtodetectthegeneticdiversityof20wildaccessionsofCynodondactyloncollectedfromXinjiang.TheresultsshowedthatthereisrichgeneticdiversityamongthewildresourcesofCynodondactylontested.Aswellasshowedthatacorrelationbetweengeneticdifferentiationandeco-geographicalhabitsamongthegroups.Keywords:Cynodondactylon;SRAP;Clusteranalysis狗牙根属(CynodondactylonL.)植物属于禾本科(Gramineae)虎尾草亚科...(Chloridoideae),为暖地型草坪草中最重要的草种之一。原产于非洲,在美国...[9]...分布于黄河流域及其以南地区,此外新疆、吉林、青海、甘肃等地也有分布。目前国外对狗牙根种质资源的研究大多集中在分子水平,国内王志勇等人行了优化及引物的筛选。易杨杰等对采自四川、重庆、贵州、西藏四省区的32...的南部、非洲、欧洲、亚洲的南部各国分布,为世界广种。在我国,狗牙根主要[1][2]对狗牙根SRAP(Sequence-relatedamplifiedpolymorphism,SRAP)-PCR体系进[3]份野生狗牙根野生狗牙根进行SRAP分子标记技术研究,认为野生狗牙根具有较为丰富的遗传多样性。新疆境内野生狗牙根资源丰富,地域环境差异大,在水平和垂直地带都有一些特殊的生境,而这些特殊生境都有野生狗牙根零星分布,而且形态表现差异较大。目前,针对新疆狗牙根的形态研究工作基本已经完成,但还没有从分子水平深入探究该种的遗传变异,所以研究其遗传多样性就显得尤为必要。本研究拟通过建立SRAP-PCR反应体系并对其进行优化,以探索新型分子标记技术SRAP在狗牙根遗传多样性研究中应用的可行性。本研究将为狗牙根基因图谱的构建、分子标记的研究提供理论基础。1材料与方法1.1材料2008年5月将由新疆各地采集的野生狗牙根材料种植于新疆农业大学试验场原始资料圃内,小区面积1m×2.5m,小区间距70cm,期间进行灌溉、杂草防除等田间管理工作。狗牙根材料编号及来源见表1。...因组DNA提取参照CTAB法,对水浴时间和抽提次数进行改进,如表2所示。...表1狗牙根材料编号及来源编号CodeCd001Cd002Cd003Cd004Cd005Cd006Cd007Cd008Cd009Cd010Cd011Cd012Cd013Cd014Cd015Cd016Cd017Cd018Cd019Cd020采集地点Location阿图什格昌吉呼图壁呼图壁托克逊库尔勒昌吉伊宁乌苏托克逊伊犁博乐阿图什格察布查尔察布查尔霍城霍城霍城霍城托克逊海拔Altitude(m)1200----8.1936-342-596540597590635717707603588-经度LongitudeN39°45.612′---N42°48.711′N41°44.515′-N81°17.683′N84°44.451′-N81°17.551′N82°00.71′N81°14.876′N81°12.292′N81°10.592′N80°56.236′N80°56.176′N80°46.850′--纬度LatitudeE76°38.544′---E88°38.546′E86°09.62...

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