Nature高粱基因组完成测序---复旦大学精品课程

Nature:高粱基因组完成测序2009年1月29日本期Nature发表了高粱(Sorghumbicolour)的基因组序列。高粱基因组-美国科学家完成测序美国能源部联合基因组研究所等机构的科学家日前完成了高粱的全基因组测序和分析,相关研究成果已刊登在29日出版的《自然》杂志上。科学家利用全基因组鸟枪测序法完成了对高粱基因组的测序。结果显示,高粱基因组大约有3万个基因,有7.3亿个核苷酸,比大米约多75%。科学家以及工业界人士认为,高粱基因组测序的完成将促进该作物的改良,并有助于完成其他相关植物的测序工作。美国能源部生物和环境研究中心副主任安娜·帕尔米萨诺说,这项研究是发展低成本、非粮食生物燃料的重要一步。美国孟德尔生物技术公司总裁尼尔·格特森则认为,这项成果将对生物燃料和可再生能源产业产生重要影响。由于耐寒且生产生物燃料的效率高,高粱目前是美国仅次于玉米的第二大生物燃料作物。此外,随着利用植物纤维生产乙醇的技术日趋成熟,高粱生长迅速的特点更让其成为理想的生物燃料来源。高粱是一种谷物,作为粮食、饲料、纤维和燃料作物广泛种植。它耐热、耐旱,是西非萨赫勒地区很多人口的一种主食作物。将该基因组与玉米和水稻的基因组所做的对比,为了解草本及C4植物光合作用(这种光合作用在高温时尤其能够高效吸收碳)的演化提供了线索。另外,可能对高粱的抗旱性能有贡献的蛋白编码基因及miRNAs也可能被找到。高粱产量的提高一直落后于其他作物,其基因组序列的获得有可能为该作物的改良产生非常重要的促进作用。(生物谷Bioon.com)高粱是全球第五大禾谷类作物,在干旱、半干旱地区农业生产中占有极其重要的位置.高粱基因组相对较小(750Mbp),遗传多样性丰富,被认为是禾谷类作物比较基因组学研究的模式基因组之一.近年来,综合运用AFLP等分子标记、BAC文库、EST及cDNA作图和FISH技术,加速了高粱高分辨率基因组图谱的构建.高粱基因测序、基因功能鉴定和克隆,以及遗传转化,亦取得了长足的进展.高粱特有的多种适应逆境胁迫等优异基因资源的发掘及其在作物改良中的应用前景广阔。高粱基因组-序列的获得高粱基因组高粱是一种谷物,作为粮食、饲料、纤维和燃料作物广泛种植。它耐热、耐旱,是西非萨赫勒地区很多人口的一种主食作物。将该基因组与玉米和水稻的基因组所做的对比,为了解草本及C4植物光合作用(这种光合作用在高温时尤其能够高效吸收碳)的演化提供了线索。另外,可能对高粱的抗旱性能有贡献的蛋白编码基因及miRNAs也可能被找到。高粱产量的提高一直落后于其他作物,其基因组序列的获得有可能为该作物的改良产生非常重要的促进作用。生物谷推荐原始出处:Nature457,551-556(29January2009)|doi:10.1038/nature07723;TheSorghumbicolorgenomeandthediversificationofgrassesAndrewH.Paterson1,JohnE.Bowers1,RémyBruggmann2,InnaDubchak3,JaneGrimwood4,HeidrunGundlach5,GeorgHaberer5,UffeHellsten3,ThereseMitros6,AlexanderPoliakov3,JeremySchmutz4,ManuelSpannagl5,HaibaoTang1,XiyinWang1,7,ThomasWicker8,ArvindK.Bharti2,JarrodChapman3,F.AlexFeltus1,9,UdoGowik10,IgorV.Grigoriev3,EricLyons11,ChristopherA.Maher12,MihaelaMartis5,ApurvaNarechania12,RobertP.Otillar3,BryanW.Penning13,AsafA.Salamov3,YuWang5,LifangZhang12,NicholasC.Carpita14,MichaelFreeling11,AlanR.Gingle1,C.ThomasHash15,BeatKeller8,PatriciaKlein16,StephenKresovich17,MaureenC.McCann13,RayMing18,DanielG.Peterson1,19,Mehboob-ur-Rahman1,20,DoreenWare12,21,PeterWesthoff10,KlausF.X.Mayer5,JoachimMessing2&DanielS.Rokhsar3,41PlantGenomeMappingLaboratory,UniversityofGeorgia,Athens,Georgia30602,USA2WaksmanInstituteforMicrobiology,RutgersUniversity,Piscataway,NewJersey08854,USA3DOEJointGenomeInstitute,WalnutCreek,California94598,USA4StanfordHumanGenomeCenter,StanfordUniversity,PaloAlto,California94304,USA5MIPS/IBIS,HelmholtzZentrumMünchen,InglostaedterLandstrasse1,85764Neuherberg,Germany6CenterforIntegrativ...

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