GelRed基本问答

GelRed/GelGreen基本问答美国技术关于marker跑电泳出现分辨率不高现象:经过比对多家的maker产品,证实Invitrogen's1kbPlusDNALadder与GelRed匹配度最好。GelRed比EB分子大(也是由于大分子特性,所以不会透过细胞膜进入人体产生伤害,染料的结合原理都是一样的)。大分子的染料在预制胶中对DNA的迁移有一定影响,但是不确定对那种类型的DNA迁移影响严重。采用后染法,不会破坏胶中的DNA样本,保证了DNA迁移的真实水平。不同于EB,你不用在对染后的胶进行脱色。针对预制胶电泳拖带、不清晰的建议:1.鉴于GelRed的高灵敏性,建议减少DNA的上样量。2.建议把GelREed再稀释一倍后使用,但过低会影响结果的灵敏性。3.用1XTBE缓冲液代替TAE,因为含硼酸盐的试剂导电性能更好。GelRed&GelGreen常见问题:Q:污染或微笑的DNA条带或错误的DNA迁移条带?A:许多客户为方便使用GelRed预制凝胶。但GelRed和GelGreen是为安全而设计的分子量较大的高效亲和型染料,在预制凝胶电泳中它们可以影响DNA的迁移。如一些限制性酶切的DNA样本,可能会在GelRed预制凝胶中异常迁移。下列建议可能会提高预制凝胶中的条带分离效果。1.减少DNA上样量。污染和微笑条带往往是过量的DNA样本造成的。推荐的泳道和已知浓度的样品的上样量为50-200ng/泳道。对于未知浓度的样品,尝试1/2或1/3的常用上样量2.减少GelRed在凝胶中的总量,比如用0.5X的浓度来代替1X的浓度。3.制百分比浓度小的琼脂糖凝胶。高分子量的DNA在低百分比的琼脂糖凝胶分离效果比较好。4.更换电泳缓冲液。TBE缓冲液比TAE缓冲液的效果更好。5.为了避免染料可能对DNA迁移的干扰,我们建议使用电泳后染胶。如果跑胶程序需要的上样量超过推荐量,建议使用电泳后染色法。Q:荧光弱,时间久染料性能降低,或使用后染法染料仍然在琼脂糖凝胶中。A:染料可能从溶液中沉淀。1.加热GelRed至45-50℃,2min,搅拌溶解。2.染料在室温下储存,以避免沉淀。Q:后染法需要去除染料的步骤吗?A:不需要,不过高背景的结果可以考虑适当脱色步骤Q:GelRed和GelGreen可以用来染色单链DNA或RNA吗?A:GelRed和GelGreen可用于单链DNA和RNA的染色,但GelRed染单链核酸效果比GelGreen敏感5倍左右。使用荧光酶标仪的滴定实验表明,GelRed绑定单链DNA和RNA荧光信号约是结合双链DNA的一半左右。Q:用那些仪器检测GelRed和GelGreen?A:GelRed完美兼容标准(302或312nm)紫外透射成像仪。GelGreen的吸光度在250-300nm和吸收峰在500纳米左右。GelGreen兼容254nm的紫外透射或可见光激发的凝胶成像仪,如DarkReader或488nm凝胶激光扫描仪。Q:什么样的发射滤波片适合使用GelRed和GelGreen?A:GelRed使用溴化乙锭滤片;GelGreen使用SYBRGreen或黄色滤片。另外,长通道黄色滤片可用于GelRed或GelGreen。请查阅GelRed和GelGreen更多的特定波长的发射光谱。Q:可以提前制作GelRed/GelGreen凝胶,储存供以后使用吗?A:可以,GelRed和GelGreen染料是稳定的。在保证琼脂糖凝胶的完整性不会被破坏的前提下,你可以将预制的GelRed/GelGreen凝胶储存供以后使用。我们建议在4℃避光贮存凝胶。Q:GelRed/GelGreen在熔化的琼脂糖中稳定么?可以将GelRed/GelGreen储存在熔化的琼脂糖胶中,到用的时候在制备凝胶吗?A:可以,GelRed比GelGreen更加稳定。但我们不建议将GelRed放在熔化的琼脂糖中存放几天。Q:GelRed/GelGreen的预制凝胶可以重复使用吗?A:不可以,我们不建议GelRed/GelGreen凝胶电泳后重复使用,因为连续电泳会减少染色强度。Q:可以重新融化GelRed/GelGreen凝胶,再制备吗?A:是的,但最好再添加一些染料,保证重新制备凝胶的信号强度。Q:GelRed和GelGreen用后应该如何处置?A:GelRed和GelGreen通过EPA环保监管局22个指标测试。GelRed和GelGreen已经被相关部门批准,可以直接倾倒入下水道。然而,由于地方规定的差异,您可以请联系您当地的安全监管部门,获取相关条例。详情请查阅GelRed/GelGreen安全报告信息。Q:GelRed及GelGreen与如克隆,连接和测序的下游扩增子兼容吗?A:可以。我们建议使用Qiagen公司或Zymoclean凝胶提取试剂盒,EXO-SAP方案,或酚氯仿抽提法去除DNA中的染料成...

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