S03季S0301SmithandJonesSmith和JonesS0302TheShakespeareCode莎士比亚密码S0303Gridlock封闭高速S0304DaleksinManhattan戴立克在曼哈顿S0305EvolutionoftheDaleks戴立克的进化S0306TheLazarusExperiment返老还童实验S030742末日42分S0308HumanNature人性S0309TheFamilyofBlood血之家族S0310Blink眨眼S0311Utopia乌托邦S0312TheSoundofDrums鼓声S0313LastoftheTimeLords最后的时间领主S0301Smith和Jones（SmithandJones）——玛莎Jones所在的医院内有外星逃犯藏身，整座医院被宇宙警察送到月球，逃犯用一种特殊的方式暂时隐藏了自己的种族，而非人类的博士却被警察追赶。氧气就快要用完了，博士用牺牲自己的方式迫使逃犯中计，及时令医院回到地球。(法师第二次出现）S0302莎士比亚密码（TheShakespeareCode）——博士和玛莎回到了过去观看玛莎的偶像莎士比亚的戏剧，竟然发现就要上映的是传说中不存在的《爱情胜利》，上映之时，女巫从舞台上飞出，原来莎士比亚被控制，戏中的台词都是解除女巫封印的词语。在莎士比亚不断创造的新词语下，女巫被再次封印。S0303封闭高速（Gridlock）——博士和玛莎来到五十亿零五十三年后的新地球的第十五纽约，却只看到地下城的贫民窟和一望无际停滞的车流，玛莎被其中一辆车劫走，博士为救玛莎也搭上了某辆车。Boe之脸为了拯救城市，将自己最后的生命转化为能量，临终前Boe之脸告诉博士他最大的秘密——YouAreNotAlone（你并不孤单）。【Boe之脸第三次出现并死亡】S0304戴立克在曼哈顿（DaleksinManhattan）——博士和玛莎回到了大萧条时期的美国，看到了帝国大厦正在建筑中，旁边的公园则住满了失业的人群，有人说公园里的人不断减少，每天都有人失踪。博士决定一探究竟，没想到又是戴立克的一个阴谋。S0305戴立克的进化（EvolutionoftheDaleks）——戴立克成功的与人类融合，而且还拥有了人类的感情，博士就想和人型戴立克合作，改造戴立克一族。但是其他戴立克却杀死了人型戴立克。最后博士和玛莎以及一名英勇的美国人合力瓦解了戴立克的阴谋。S0306返老还童实验（TheLazarusExperiment）——英国的一名著名教授从蝎子体内提取了一些令他返老还童的物质和一套机器，成功从70多岁的老人变成一个20、30多岁的年轻人。但变异正在教授的体内发生，他变成了一只巨大的蝎子，杀死了自己的合作伙伴。后来在约会玛莎的妹妹的时候再次变身，还失去理智到处杀人，最终被博士阻止。S0307末日42分（42）——博士和玛莎在太空旅行的途中误上了一艘使用违禁手段的采矿船，而船再过42分钟后就会坠入太阳。在船上有两个人不知何故体温不断提高，并且变得极度凶残危险。后来博士才发现原来这里的太阳实际上是一种生命体，由于采矿船实际上在挖掘生命体的核心，所以它要报复船上的人。最后船上的人打开仓库丢弃所有太阳物质后终于脱险。S0308人性（HumanNature）——博士为了躲避宇宙中的一个嗜血家族而令自己变成人类，将所有记忆和力量隐藏在一只怀表里，化名约翰•史密斯(JohnSmith)在英国的一家著名大学当老师，玛莎则成了他的黑人女仆，博士还和学校里的护士长坠入爱河。然而外星人还是追来了，学校附近不断有人被抓去做这个家族的寄生者，而被外星人控制的稻草人四处攻击学生，更严重的是怀表丢了。S0309血之家族（TheFamilyofBlood）——博士的身份暴露了，然而人类博士却不敢面对，他放不下约翰•史密斯的生活和爱情。后来一名学生把怀表交给博士，博士终于打开怀表，释放自己的一切记忆与能量。最终博士制裁了嗜血家族的四名人员：父亲推进异空间，母亲被锁进了废弃的白矮星的核心，妹妹被放到了镜子中的世界，而哥哥则变成了一个稻草人，至今仍在守望英国的土地。而且他们四个都得到了他们所想要的——永生。这时家族才明白，其实博士完全有能力对付他们，原先的逃跑躲避只是博士太仁慈，不想伤害他们。S0310眨眼（Blink）——一名英国女生SallySparrow在一所“鬼屋”探险时撕开墙纸，墙上竟然有她的名字，还写着“快逃，小心石像”的字眼。于是她第二天与一位朋友一同再来，她听见门铃响去开门，而她的朋友却突然消失了。这时门外进来一位自称是她的...