RASSF1A对恶性黑色素瘤A375细胞基因表达谱的影响

RASSF1A对恶性黑色素瘤A375细胞基因表达谱的影响#易梅1,李小玲2,向波2,谢红付1*51015(1.中南大学湘雅医院皮肤性病科,长沙410008;2.中南大学肿瘤研究所,长沙410008)摘要:RASSF1A(Rasassociationdomainfamily1isoformA)是定位于染色体3p21.3区域的抑瘤基因,编码一个由340个氨基酸残基构成的微管相关蛋白。该基因在包括恶性黑色素瘤在内的多种肿瘤中因启动子高甲基化而表达沉默.本研究建立了RASSF1A稳定表达的恶性黑色素瘤A375细胞系,通过全基因组表达谱基因芯片分析RASSF1A过表达对A375细胞基因表达谱的影响,发现RASSF1A引起184个基因表达上调,26个基因表达下调。通过realtimeRT-PCR对部分差异表达基因进行验证,结果表明与芯片筛选结果一致。RASSF1A影响的差异表达基因功能上归属于细胞生长与增殖、细胞周期、细胞凋亡、细胞间粘附、信号传导等生物过程。采用STRING软件构建了RASSF1A影响的差异表达基因调控网络,结果表明RASSF1A调控的差异表达基因构成一个高连接度的基因网络。其中,炎症细胞因子、转录因子位于网络中央。RASSF1A通过影响炎症细胞因子与转录因子之间的表达影响A375细胞基因网络,调节黑色素瘤恶性生物学行为。关键词:恶性黑色素瘤;RASSF1A;基因微阵列;基因表达谱:R75,Q7520GeneExpressionProfileModulatedbyRASSF1AOver-ExpressioninMelanomaA375CellsYIMei1,LIXiaoling2,XIANGBo2,XIEHongfu1(1.DepartmentofDermatology,XiangyahospitalofCentralSouthUniversity,ChangSha410008;253035402.CancerresearchinstituteofCentralSouthUniversity,ChangSha410008)Abstract:Generegulatorynetworkshaveanimportantroleineveryprocessoflife,includingcelldifferentiation,metabolism,thecellcycleandsignaltransduction.TheRASSF1Aisatumorsuppressorgeneinvolvedinseveralgrowthregulatoryandpro-apoptoticpathways.Inthisstudy,wehaveusedmicroarraytechnologytodefinedifferencesinthegeneexpressionprofilessubsequenttoexogenouswild-typeRASSF1AinmelanomaA375cells.GeneexpressionchangeswereverifiedinasubsetofgenesusingrealtimeRT-PCR.AssociationofmodulatedgeneswithbiologicalfunctionalgroupsidentifiedseveralpathwaysaffectedbyRASSF1Aincludingcelldeath,cellulargrowthandproliferation,andcellulardevelopment.GRNofmodulatedgeneswereidentifiedusingtheSTRING.Pro-inflammatoryfactorsandtranscriptionfactorslocatesinthecenterofRASSF1Amodulatedgeneregulatorynetworks.OurresultssuggestedthatRASSF1Amightaffectmelanomageneregulatorynetworkviamodulatingtheexpressionandinteractionbetweenpro-inflammatoryfactorsandtranscriptionfactors.Keywords:malignantmelanoma;RASSF1A;microarray;geneexpressionprofile0引言基因调控网络(generegulatorynetwork)是指细胞内(或特定一个基因组内)基因和基因之间的相互作用关系所形成的网络,几乎所有的生命活动都是受到基因网络的调控。孤立地研究单个基因及其表达难以真实反映生命现象的内在规律。后基因组时代,以系统的观点来研究高度复杂的生命现象是生命科学研究的趋势。构建基于芯片数据的基因调控网---本文来源于网络,仅供参考,勿照抄,如有侵权请联系删除---基金项目:教育部高等学校博士学科点基金(20110162120009)作者简介:易梅,(1981-),女,助理研究员,主要从事皮肤肿瘤及皮肤疾病研究。plumyi@163-1----本文来源于网络,仅供参考,勿照抄,如有侵权请联系删除---45505560络,找到最能反映基因之间相互关系的网络表达特征,具有十分重要的生物学意义。RASSF1A(Rasassociationdomainfamily1isoformA)是定位于染色体3p21。3区域的抑瘤基因[1-3]。研究发现,RASSF1A具有促进细胞凋亡、诱导细胞周期G1-S期阻滞和诱导细胞衰老的功能[4,5]。本研究发现过表达RASSF1A抑制了恶性黑色素瘤A375细胞生长。全基因组表达谱芯片分析发现RASSF1A引起A375细胞184个基因表达上调,26个基因表达下调。生物信息学分析表明RASSF1A影...

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