LIMS与检测仪器接口技术实现数据自动化采集

LIMS与检测仪器接口技术实现数据自动化采集黄晓凤王会波李长青摘要:实验室信息管理系统(LIMS)是规范实验室操作、提高实验室管理的平台和途径,自动采集检测仪器数据在LIMS的实现是提高数据准确性,加强管理效能的一个重要环节。本文在介绍本中心LIMS与检测仪器接口的基础上,结合北京三维天地公司LIMS(SW-LIMS)项目的实践经验,以中心实验室Ruantstudio7flex荧光定量PCR仪为例,对LIMS接口的改进及效果进行了分析,旨在为业务科室间检测数据资源的信息共享提供参考。关键词:LIMS;PCR仪;接口;数据采集:TP274:BDOI:10.3969/j.issn.1006-1959.2020.03.006:1006-1959(2020)03-0021-03LIMSandDetectionInstrumentInterfaceTechnologyforAutomaticDataCollectionHUANGXiao-feng,WANGHui-bo,LIChang-qing(DepartmentofQualityManagement,ShunyiDistrictCenterforDiseaseControlandPrevention,Bei激ng101300,China)Abstract:Thelaboratoryinformationmanagementsystem(LIMS)isaplatformandwaytostandardizelaboratoryoperationsandimprovelaboratorymanagement.TherealizationofautomaticcollectionoftestinginstrumentdatainLIMSisanimportantlinktoimprovedataaccuracyandstrengthenmanagementefficiency.Basedontheintroductionoftheinterfacebetweenthecenter'sLIMSanddetectioninstruments,thiscombinesthepracticalexperienceoftheBei激ngThree-dimensionalWorldCorporation'sLIMS(SW-LIMS)projectwiththecentrallaboratoryRuantstudio7flexfluorescencequantitativePCRinstrumentasacase.TheimprovementandeffectoftheLIMSinterfaceareanalyzed,andthepurposeistoprovideareferencefortheinformationsharingofdetectiondataresourcesbetweenbusinessdepartments.Keywords:LIMS;PCRinstrument;Interface;Dataacquisition现代检验检测实验室的一个重要特点就是利用实验仪器代替传统的手工检测方法,在实验室信息管理系统(LIMS)未与检测仪器对接前,检测仪器产生的数据都是通过人工录入到LIMS中,再经过三级审核形成最终的检测报告[1]。手工录入易造成数据错误或偏差,增加了检测科室核对数据和修改数据的工作量,降低了工作效率[2]。随着信息技术的发展,LIMS和设备接口技术得以实现,LIMS可自动采集检测仪器的数据[3,4]。检测仪器和LIMS接口的使用,提高了实验数据的准确性、溯源性和数据的自动化管理,同时也满足了检验检测人员减少人工录入和加强实验室管理的目标[5,6]。在疾病预防控制中心检测实验室,荧光定量PCR仪对日常监测的流行性感冒、手足口病、肠道传染病、呼吸道传染病等常规监测病种需要48h内出具检测结果,如果核酸检测结果为阳性,要在2h内上报上级部门进行复核;如果发生疫情,结果的准确性、及时性更为迫切。传染病监测是疾控实验室的首要任务,但目前检测过程复杂、耗时长,工作强度大,检测效率低[7]。而LIMS与荧光定量PCR仪对接后可实现自动化检测,释放人力资源,降低劳动强度,避免因人工录入错误导致的质量异议发生。考虑到荧光定量PCR仪可检测样本范围广的特性,本文提出了LIMS与荧光定量PCR仪接口的实现技术,由LIMS系统接收样本信息后,自动分配PCR仪,将检测信息发送给实验设备,检测结束后将结果数据返回LIMS系统,经由检查人员审核即可,现将实现情况介绍如下。1SW-LIMS与检测仪器接口概述我中心正在开发的三维天地LIMS(SW-LIMS)已经与不同厂商的数百种检测仪器建立了接口连接,内置的DCU(数据采集模块)向导可以引导用户如何打开文件,从文件中解析相关数据,同时将数据采集到SW-LIMS的数据库中[8]。我中心实验室检测仪器种类繁多,样品理化分析仪器包括气相色谱仪、高效液相色谱仪、原子吸收风光光度计、连续流动分析仪、原子荧光光度计、气相色谱-质谱仪、液相色谱-质谱仪等;病原样本分析仪器包括荧光定量PCR仪、酶标仪、细菌鉴定仪、生物质谱仪等;样品前处理及称量所用的各类电子天平等;SW-LIMS提供的数据自动采集的方法按照以上检测仪器分為3类:①自带附属工作站的仪器;②没有数据工作站但可以通过RS232串口输...

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