生物化学与分子生物学专业优秀论文1.人类上游结合因子hUBF的DNA结合结构域（HMGbox5）的晶体结构及其与细胞周期调节因子TAF1（TBP相关因子）的相互作用；2.枯草杆菌中5-氨基酮戊酸脱水酶的初步晶体学与功能的研究关键词：蛋白表达转录因子基因调控摘要：1．人类上游结合因子hUBF的DNA结合结构域的晶体结构及其与细胞周期调节因子TAF1的相互作用hUBFHMGbox5蛋白结构的核心特点：一个L型的三段阿尔法螺旋花样和简单的上下拓扑结构。hUBFHMGbox5蛋白的晶体结构和核磁结构有着相似的折叠方式，但是两者又有着非常明显的不同。两者的表面残基在构象上有着较大的差异，有的高达9.0A。这种两个结构的不同反应了hUBFHMGbox5蛋白的两种潜在的状态。当与TAF1蛋白发生相互作用时，hUBFHMGbox5蛋白的结构就发生了变化，这一点在核磁滴定实验中已经表明。此外，我们证实了hUBFHMGbox5蛋白与TAF1-bm1蛋白的直接的相互作用，并提出了hUBFHMGbox5蛋白与TAF1-bm1蛋白的可能的相互作用的位点。我们的结果，对于进一步了解RNA聚合酶在细胞周期调节中的分子机制提供了信息。2．来源于皖南山区的一种新型心脏毒类似蛋白的纯化，鉴定与初步晶体学研究通过两步柱层析方法，从来源于皖南山区的中华眼镜蛇毒腺中纯化获得了一种新型的心脏毒碱性蛋白的类似蛋白，基本的溶血试验表明，此蛋白在没有卵磷脂参与下，不具有直接的溶血活性。在低浓度卵磷脂条件下(0.005-0.1％)，能检测到溶血活性，并且随卵磷脂浓度上升而溶血活性下降。此蛋白的致死活性试验表明，CLBPah毒性强于CLBP，但是又低于心脏毒蛋白和神经毒蛋白。通过传统的悬滴法，获得了此蛋白的晶体，衍射分辨率达2.35A，结构正在解析中，如果能获得更全面的序列信息，将能够更深入地了解心脏毒类似碱性蛋白的结构学特性，以及为了解心脏毒蛋白和心脏毒类似碱性蛋白的进化关系提供帮助。3．枯草杆菌中5-氨基酮戊酸脱水酶的初步晶体学与功能的研究通过传统的悬滴法，在室温条件下，我们获得了枯草杆菌ALAD酶的晶体，但衍射能力较差，无论是在本实验室还是在北京高能所，衍射最高分辨率都只能在2.8A左右，且镶嵌度很高，在初步获得的晶体结构中，温度因子平均达到80A<&#39;2>以上，并且在一些重要的环区域的氨基酸电子云密度极差，整体结构显示，晶体有明显缺陷，还需要进一步优化晶体生长，以期获得堆积效果更好的蛋白质晶体。同时，有文献报道，原卟啉九是ALAD酶的重要抑制物，考虑到人类一系列与血卟啉相关的疾病都与ALAD的酶失活相关，而原卟啉九正是这一代谢途径下游的中间产物，推测原卟啉九可能在此系列疾病中有相关的致病机制，为此，我们还需要获得ALAD的酶与原卟啉九的复合物晶体结构。这个酶的最适pH范围比较宽，热稳定性较好。测序结果显示的酶活中心含有保守的Cys和His残基，推测此酶为Zn依赖性酶，在酶液中加入EDTA后完全丧失酶活，加入Cu<&#39;2>和Hg<&#39;2+>显著地抑制了酶活，这些都进一步证明枯草杆菌ALAD是Zn依赖性酶，而K<&#39;+>、Li<&#39;+>、Mg<&#39;2+>、Mn<&#39;2+>和Fe<&#39;3+>都显著地增加了酶活力，表明无论是单价还是三价的金属离子都可以增加该酶活力。由于枯草杆菌ALAD是含有Cys残基的酶，所以加入β-巯基乙醇后酶活有所增加，但是随着加入的二硫苏糖醇浓度的增大酶活却逐渐减弱，推测它影响酶活中心半胱氨酸和金属离子的结合，这一点与所报道的其它物种的ALAD的性质有很大的差别。正文内容1．人类上游结合因子hUBF的DNA结合结构域的晶体结构及其与细胞周期调节因子TAF1的相互作用hUBFHMGbox5蛋白结构的核心特点：一个L型的三段阿尔法螺旋花样和简单的上下拓扑结构。hUBFHMGbox5蛋白的晶体结构和核磁结构有着相似的折叠方式，但是两者又有着非常明显的不同。两者的表面残基在构象上有着较大的差异，有的高达9.0A。这种两个结构的不同反应了hUBFHMGbox5蛋白的两种潜在的状态。当与TAF1蛋白发生相互作用时，hUBFHMGbox5蛋白的结构就发生了变化，这一点在核磁滴定实验中已经表明。此外，我们证实了hUBFHMGbox5蛋白与TAF1-bm1蛋白的直接的相互作用，并提出了hUBFHMGbox5蛋白与TAF1-bm1蛋白的可能的相互作用的位点。我们的结...