基于网络药理学与分子对接探讨黄芪治疗溃疡性结肠炎的作用机制

基于网络药理学与分子对接探讨黄芪治疗溃疡性结肠炎的作用机制郝民琦王佳慧李晓玲李海龙吴玉泓R285;R574.1文献标志码A1001-0408(2021)10-1215-09DOI10.6039/j.issn.1001-0408.2021.10.10摘要目的:预测黄芪对溃疡性结肠炎(UC)的可能作用靶点与机制,为临床应用黄芪治疗UC的后续研究提供参考。方法:经中药系统药理学分析平台数据库(TCMSP)和UniProtKB数据库检索黄芪的活性成分及其对应靶点基因,经GeneCards数据库检索UC疾病相关靶点基因,借助Venny2.1.0在线作图工具获取黄芪与UC的交集靶点基因,并应用Cytoscape3.7.0软件构建“药物-化合物-交集靶点”相互作用网络。利用STRING数据库获取交集靶点的蛋白质-蛋白质相互作用关系(PPI)网络,并应用Cytoscape3.7.0软件进行可视化分析和拓扑学分析以获取核心靶点基因。借助DAVID数据库对交集靶点基因进行基因本体(GO)功能注释及KEGG通路富集,并应用Cytoscape3.7.0软件构建“靶点-通路”富集网络。通过AutoDockvina1.1.2软件将度值排名前5位的活性成分与核心靶点基因编码蛋白进行分子对接,应用DiscoveryStudio3.5软件绘制结合模式图。结果:黄芪中共有化合物143个,共筛选出了活性成分20个,对应的靶点基因189个;UC疾病相关靶点基因共4356个。黄芪(涉及14种活性成分)与UC的交集靶点基因有126个。PPI网络中的核心靶点基因为AKT1、MAPK1、RB1、JUN等。GO功能注释共得到GO条目2294个(q值关键词黄芪;活性成分;溃疡性结肠炎;网络药理学;分子对接;作用机制StudyontheMechanismofAstragaliRadixintheTreatmentofUlcerativeColitisBasedonNetworkPharmacologyandMolecularDockingHAOMinqi1,2,3,WANGJiahui1,2,LIXiaoling1,2,LIHailong2,4,WUYuhong1(1.SchoolofBasicMedicine,GansuUniversityofTCM,Lanzhou730000,China;2.KeyLaboratoryofDunhuangMedicineandItsTransformationofMinistryofEducation,GansuUniversityofTCM,Lanzhou730000,China;3.KeyLaboratoryofTCMMiningandInnovationTransformation,GansuUniversityofTCM,Lanzhou730000,China;4.FirstClinicalMedicialSchool,GansuUniversityofChineseMedicine,Lanzhou,730000,China)ABSTRACTOBJECTIVE:TopredictthepotentialtargetandmechanismofAstragaliRadixinthetreatmentofulcerativecolitis(UC),andtoprovidereferencefortheclinicalapplicationofAstragaliRadixinthetreatmentofUC.METHODS:TheactivecomponentsandtheircorrespondingtargetgenesofAstragaliRadixwereretrievedbyTCMSPandUniProtKBdatabase.TherelatedtargetgenesofUCweresearchedbyGeneCardsdatabase.TheintersectiontargetgenesofAstragaliRadixandUCwereobtainedbyVenny2.1.0onlinemappingtool,andinteractionnetworkof“drug-compound-intersectiontarget”wasconstructedbyusingCytoscape3.7.0software.PPInetworkofintersectingtargetswasobtainedbyusingSTRINGdatabase,andthevisualizationanalysisandtopologicalanalysiswerecarriedoutbyusingCytoscape3.7.0softwaretoobtainthecoretargetgenes.ByusingDAVIDdatabase,thegeneontology(GO)functionannotationandKEGGpathwayenrichmentofintersectingtargetgeneswerecarriedout,andthe“target-pathway”enrichmentnetworkwasconstructedbyusingCytoscape3.7.0software.ThroughAutoDockvina1.1.2software,thetopfiveactivecomponentsinthelistofdegreevaluewerelinkedwiththeproteinencodedbythecoretargetgenes;DiscoveryStudio3.5softwarewasappliedtodrawoutbindingpatternmap.RESULTS:Therewere143compoundsinAstragaliRadix,20activecomponentswerescreenedout,and189correspondingtargetgeneswereselected;therewere4356UCdiseaserelatedtargetgenes.Therewere126intersectiontargetgenesofAstragaliRadix(involving14activecomponents)andUC.ThecoretargetgenesinPPInetworkwereAKT1,MAPK1,RB1,JUN,etc.Atotalof2294GOitems(qvalueKEYWORDSAstragaliRadix;Activeingredients;Ulcerativec...

1、当您付费下载文档后,您只拥有了使用权限,并不意味着购买了版权,文档只能用于自身使用,不得用于其他商业用途(如 [转卖]进行直接盈利或[编辑后售卖]进行间接盈利)。
2、本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺!文档内容仅供参考,付费前请自行鉴别。
3、如文档内容存在侵犯商业秘密、侵犯著作权等,请点击“举报”。

常见问题具体如下:

1、问:已经付过费的文档可以多次下载吗?

      答:可以。登陆您已经付过费的账号,付过费的文档可以免费进行多次下载。

2、问:已经付过费的文档不知下载到什么地方去了?

     答:电脑端-浏览器下载列表里可以找到;手机端-文件管理或下载里可以找到。

            如以上两种方式都没有找到,请提供您的交易单号或截图及接收文档的邮箱等有效信息,发送到客服邮箱,客服经核实后,会将您已经付过费的文档即时发到您邮箱。

注:微信交易号是以“420000”开头的28位数字;

       支付宝交易号是以“2024XXXX”交易日期开头的28位数字。

客服邮箱:

biganzikefu@outlook.com

所有的文档都被视为“模板”,用于写作参考,下载前须认真查看,确认无误后再购买;

文档大部份都是可以预览的,笔杆子文库无法对文档的真实性、完整性、准确性以及专业性等问题提供审核和保证,请慎重购买;

文档的总页数、文档格式和文档大小以系统显示为准(内容中显示的页数不一定正确),网站客服只以系统显示的页数、文件格式、文档大小作为依据;

如果您还有什么不清楚的或需要我们协助,可以联系客服邮箱:

biganzikefu@outlook.com

常见问题具体如下:

1、问:已经付过费的文档可以多次下载吗?

      答:可以。登陆您已经付过费的账号,付过费的文档可以免费进行多次下载。

2、问:已经付过费的文档不知下载到什么地方去了?

     答:电脑端-浏览器下载列表里可以找到;手机端-文件管理或下载里可以找到。

            如以上两种方式都没有找到,请提供您的交易单号或截图及接收文档的邮箱等有效信息,发送到客服邮箱,客服经核实后,会将您已经付过费的文档即时发到您邮箱。

注:微信交易号是以“420000”开头的28位数字;

       支付宝交易号是以“2024XXXX”交易日期开头的28位数字。

文秘专家
机构认证
内容提供者

1

确认删除?