基于ITS序列探讨南瓜属植物系统发育

基于ITS序列探讨南瓜属植物系统发育(1.福建省农科院农业生物资源研究所,福建福州350003;2.福州市农业科学研究所,福建福州350018)摘要:基于ITS序列对南瓜属三个种(中国南瓜、美洲南瓜和黑籽南瓜)的系统发育进行了研究。结果发现,ITS1全长1熒・191bp,ITS2全长251・263bp;南瓜ITS1序列的变异位点数为33,占1TS1全序列的的17.55%,ITS1序列的信息位点数为24,占ITS1全序列的12.77%,南瓜ITS2序列的变异位点数为45个,占ITS2全序列的17.93%,ITS2的信息位点数为引个,占ITS2全序列的12.35%;ITS1的G+C含量变化范围为51.60%-54.60%,ITS2的G+C含量变化范围为53.78%-56.98%;基于ITS1和ITS2分别构建的系统树可以看出,中国南瓜和美洲南瓜的亲缘关系较近,与黑籽南瓜的亲缘关系较远。本研究对南瓜的系统演化具有一定指导意义。关键词:核糖体,内转录间隔区,南瓜属,系统发育中图分类号:文献标识码:A文章编号:PhylogenyoftheGenusCucurbitaBasedonITSSequenceDataWUYu-fen1,ZHOUXian-zhi1,CHENSheng1,CHENYang1,ZHAOYi-jie2(1.AgriculturalBio-resourcesResearchInstitute.FujianAcademyofAgriculturalSciences>Fuzhou>Fujian350003,China;2.FuzhouInstituteofAgricuhura!Sciences9Fuzhou,Fujian35001&China)Abatract:Therelationshipsanddifferencesamongthespeciesofmoschatapepoandficifofia(Cucurbitaceae:Cucurbita)wereexaminedusingdatafromtheinternaltranscribedspacer(ITS)regionofthenuclearribosomalDNA・TheITSsequenceswereobtainedfrom13speciesofmoschata4speciesofpepoand2speciesoificifofia・Theresultsshowedthat,WithinCucurbita,ITS1is188-191bp(C・moschata,C.pepoandC.ficifofia)andITS2rangesfrom251一263bp(C・moschata,C.pepoandC・ficifofia).33variablepositions(17.55%)and24informativesites(12.77%)withinCucurbitaarcfoundintheITS1sequences.45variablepositions(17.93%)and31informativesites(12.35%)withinCucurbitaarefoundintheITS2sequences.TheG+CcontentofITS1is51.60%-54.60%andthatofITS2ranges收稿日期:修回日期:基金项目:省科技厅璽点项目(200710037);省自然基金(2009J01069)第一作者简介:吴宇芬(1965-),女.副研究员,研究方向:主耍从班西瓜、•甜瓜及砧木新品种选育与栽培技术研究.通讯作者简介:周先治.男.1976年出生■助理研究员.博士.从事生物资源研究.E-mail:xian7hi7hou@l26.com.from53.78%to56.98%・TheresultingtreesfromITS1andITS2sequencesshowedthattherelationshipbetweenC・moschataandC・pepowascloserthanthatbetweenC・moschataandC.ficifofia・ThisstudywassignificantinresearchtheGenusCucurbitaevolution.Keywords:RibosomeDNA(rDNA);Internaltranscribedspacer(ITS);Cucurbita;phylogeny南瓜原产于南美洲,后传入我国,一年生蔓生草本植物。南瓜种质资源十分丰富,所含物种数量超过芸苔屈Brassica和蒂茄属Lycopers]on0南瓜屈包含5个栽培种:中国南瓜Cucurbitamoschata,美洲南瓜C.pepo,印度南瓜C.maxima»灰籽南瓜加x/a和黑籽南瓜C..弁(?〃0加。除栽培种Z外,南瓜属至少包括12个野生种⑴。这些种Z间的遗传基础、亲缘关系极为复杂。己有学者采用同工酶⑺、RAPD(R^mdornAmplifiedPolymorphicDNA,随机扩增多态性DNA)®®、AFLP(AmplifiedFragmentLengthPolymorphism,扩增片段长度多态性)⑺、SSR(SimpleSequenceRepeat,简单序列重复)凶、SRAP(Sequence-RelatedAmplifiedpolymorphism,相关序列扩增多态性)切等技术进行了南瓜属植物遗传多样性研究,表明南瓜属植物遗传多样性丰富,同样也揭示了南瓜属不同种间亲缘关系的远近。真核生物核糖体内转录间隔区ITS(Internaltranscribedspacer)(I8S-5.8S-26S)所受的选择压力小,与编码区相比,进化速率较快[叫在物种间表现出较高的差异。因此,真核生物细胞基因组中内转录间隔区序列可以作为一•种遗传标记。ITS是最常用作属、种、种下水平遗传分析的片段,截至2004年10月在GenBanK中被子植物的ITS序列超过36000条W该片段12成功应用于杜鹃属2、睡莲属丽...

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