不同产区碎米荠nrDNAITS序列分析及亲缘关系鉴定

不同产区碎米#nrDNAITS序列分析及亲缘关系鉴定摘要:堇叶碎米笄、壶瓶碎米笄与恩施碎米莽存在命名混乱的现象,从植株外部形态来看难以区分。为研究其亲缘关系,分别从4个有代表性的地点采集不同的居群,进行核糖体基因(nrDNA)的内转录间隔区(ITS)序列比较分析,并构建其系统发育树。结果表明,所有4份材料ITS序列全长均为709bp,其中来自宜昌长阳和五峰的材料碱基序列完全一致,与来自恩施和壶瓶的序列相比,分别冇两个碱基位点不同,4个群体的碎米养(CardaminehirsutaL.)可以聚为一支,居群之间的遗传距离很近,为0〜0.003,这种差异未超过一个种范围内的变异,初步证明4个不同产地的碎米弄为同一个种,归为堇叶碎米奔。关键词:碎米笄(CardaminehirsutaL.);核糖体nrDNA;内转录间隔区(ITS);序列分析:R282文献标识码:A:0439-8114(2014)19-4737-04D0I:10.14088/jki.issn0439-8114.2014.19.061nrDNAITSSequencesAnalysisandGeneticRelationshipTdentificationofCardaminefromDifferentGeographicalRegionsXIANG激-qianl,2,LIXi~xiang3,WANGMengl,YINHong-qingl,2,SHUAIChao-qunl,2,ZHUYun-fenl,2(1.EnshiAutonomousPrefectureAcademyofAgriculturalSciences,Enshi445002,Hubei,China;2.EnshiSeleniumInstituteofAppliedTechnologyandProductDevelopment,Enshi445002,Hubei,China;3.InstituteofVegetablesandFlowers,ChineseAcademyofAgriculturalSciences,Bei激ng100081,China)Abstract:Carclamineviolifolia,Cardaminehupin^shanensisandCardamineenshiensisexistthephenomenonofconfusednaming.Theyaredifficulttobedistinguishodfromtheoxternalformoftheplant.TnordertostudythegeneticrelationshipofCardaminehirsuta,differentpopulationsfromfourrepresentativeplacewerecollectof.RibosomalDNA(nrDNA)internaltranscribedspacer(ITS)sequenceswerecomparativelyanalyzed.Thephylogenetictreewasconstructed・Theresultsshowedthatthefull-lengthITSsequencesofallmaterialstestedwere709bp,consistedwiththematerialbasesequencesfromChangyangandtheWufeng・ThereweretwobasesitesdifferentfromEnshiandHuping.ThefourgroupsofCardaminehirsutawereinonecluster.Thegeneticdistancebetweenpopulationswasbetween0〜0.003,notexceedingarangeofvariation.ItisindicatedthattheCardaminehirsutaoffourdifferentoriginsarethesamespeciesastheCardamineviolifolia・Keywords:CardaminehirsutaL.;ribosomalDNAnrDNA;internaltranscribedspacer(ITS);sequenceanalysis碎米弄(CardaminehirsutaL.)[1]为十字花科碎米弄属1〜2年生草本植物,生长在海拔约1000m的山坡林下沟边湿地,全国各地均有野生,是近年来研究较多的聚硒植物。壶瓶碎米笄(Cardaminehupingshanensis)由湖南师范大学刘林翰、刘克明发现并命名,主要分布在湖南北部的壶瓶山一带[2]o2000年湖南农业大学向天勇[3]在湖北省恩施州硒矿区鱼塘坝发现近似植物,并定名为恩施碎米奔(Cardamineenshiensis)o傅书遐[1]、彭诚等[4]将在此处发现的碎米莽鉴定为堇叶碎米弄(Cardamineviolifolia),随后白宏锋等[5]将壶瓶碎米弄与近年来所报道的恩施碎米养以及堇叶碎米芹归为同一个种,孙紫薇等[6]分析了恩施渔塘坝地区碎米芹的形态特征与核型,发现该地区碎米芹存在居群间分化,属堇叶碎米莽。王玉兵等[7]又把在湖北省五峰、长阳发现的近似植物鉴定为壶瓶碎米菩,2013年中国科学技术大学教授尹雪斌研究组将在湖北恩施发现的超富硒植物定名为壶瓶碎米笄。综上所述,恩施碎米笄、堇叶碎米霁及壶瓶碎米霁存在命名混乱的情况,其命名在世界植物学界争论激烈,且从植株外部形态来看非常接近,难以区分,均具有很高的硒富集能力。高等植物的核糖体DNA(Ribosomal,rDNA)是由串联重复的多拷贝序列组成,每个拷贝包括编码区和内转录间隔区,编码区包括18S、5.8S和26S基因,序列高度保守,进化速率慢,常用于探讨分类学上科及以上分类单位的系统发育问题[8];编码区之间为内转录间隔区(Internaltranscribeds...

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