传播动力学的更新方程模型在云南新冠肺炎流行中的运用

传播动力学的更新方程模型在云南新冠肺炎流行中的运用摘要:目的描述云南省新型冠状病毒肺炎疫情暴发早期的流行病学特点,建立传播动力学模型并估算主要参数,为制定最优防控策略提供科学依据。方法依据云南省2020年1月21日至3月9日官方网络报道的疫情数据,用R4.0.2软件进行描述性流行病学分析,用更新方程模型分析疫情的动态变化过程并估算基本再生数(R0)。结果截止2020年3月9日,云南省累计确诊174例感染病例,其中治愈170例,死亡2例。发病年龄为41.01±18.54岁,病死率为1.15%(2/174),从出现症状到住院的时间间隔中位数为3天,从住院到报告的延迟中位数为2天。人际传播时间间隔中位数为1天,R0的中位数为0.267(95%可信区间:0.204~0.347)。结论云南省R0的估计值远小于临界值1.0,显示新型冠状病毒疫情在云南得到有效控制,可预见在常态防控形势下,疫情暴发的可能性很小。更新方程模型可用于分析及预测疫情的动态变化过程,为防止疫情反弹及境外输入采取精准施策提供理论依据。关键词:新型冠状病毒肺炎;传播动力学模型;基本再生数(R0);云南省:R563文献标识码:ARenewalequationmodeloftransmissiondynamicsforapplicationtoCOVID-19epidemicinYunnanCHENZheng-激1,WEITao2,LIHai-dong1,FENGLin-hong1,LIUHe-nan1,LINing1,GURong-yan1,ZHANGLing1,LIUWei1,ZHANGXu-sheng31.SchoolofPublicHealth,KunmingMedicalUniversity,Yunnan650500,China;2.Library,KunmingMedicalUniversity,Yunnan650500,China;3.CentreforInfectiousDiseaseSurveillanceandControl,PublicHealthEngland,LondonNW95EQ,UK)Abstract:ObjectiveToprovidescientificbasisfortheoptimalstrategiesofpreventionandcontrolofCOVID-19pandemic,weanalyzedthecharacteristicsofCOVID-19epidemicoutbreakinYunnanprovince,andproposedatransmissiondynamicsmodeltodescribetheepidemicandestimateditsimportantepidemiologicalparameters.MethodsThelinelistdataofinpidualcasesofYunnanprovincefromJanuary21toMarch9,2020werecollected.ThedescriptiveepidemiologicalanalysiswascarriedoutusingR4.0.2software.Arenewalequationmodelwasproposedtoanalyzethetransmissiondynamicprocessoftheepidemicoutbreakanditsbasicreproductionnumber(R0).ResultsUntilMarch9,2020,atotalof174caseshadbeenconfirmedwith170curedand2died.Theageofcaseswas41.01±18.54yearswiththecasefatalityrateat1.15%(2/174).Themediandelayfromonsetofsymptomstohospitalizationwasestimatedat3daysandthemediandelayfromhospitalizationtoreportingat2days.Themeanofserialinterval,thetimebetweensuccessivecasesinachainoftransmission,wasestimatedat1day.AssumingthisestimateofserialintervaldistributionR0wasestimatedat0.267(95%confidenceinterval(CI):0.204–0.347).ConclusionsTheestimateofR0ismuchsmallerthanthecriticalvalue1.0,whichindicatesthatCOVID-19waswellundercontrolandit`sunlikelytocauselargeoutbreaksundercurrentcontrolsituationsinYunnanprovince.Therenewalequationmodelissimpleforpracticaluse:itcanbeusedtoanalyzeandpredictthedynamicprocessoftheepidemicandtoprovidetheoreticalbasisfortheadoptionofprecisemeasuresforanypotentialreboundoftheepidemicinfuture.Keywords:COVID-19;Transmissiondynamicsmodel;Basicreproductionnumber(R0);Yunnan自2019年12月以来,武汉市暴发了新型冠状病毒肺炎(COVID-19,新冠肺炎)疫情。在武汉封城前两天,2020年1月21日,云南确诊了首例输入性新冠肺炎,随即开展了有效的防控措施,遏制了疫情的扩散。鉴于云南位于边境地区,存在境外持续输入新冠肺炎的风险,为防止疫情反弹,应用动力学模型评估及优化防控策略具有重要意义。本研究通过分析云南的疫情数据,建立传播动力学模型并估算主要参数,评估其早期防控措施及效果,为优化云南省疫情防控干预策略提供科学依据。1资料与方法1.资料1.1.1数据本研究病例数据于云南省2020年1月21...

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