小麦中国春背景中长穗偃麦草染色体特异分子标记的发展陈士强1，朱雪1，张超1，曹文广2，GeorgeFedak2，陈建民1**51015202530354045（1.扬州大学生物科学与技术学院，江苏扬州225009；2.加拿大东部谷物与油料研究中心，渥太华）摘要：根据大麦反转录转座子BARE-1的LTR保守区域及水稻反转录转座子RIRE-1的反转录酶中心序列自行设计11条引物，组成52个引物组合对中国春-长穗偃麦草二体附加系及代换系、普通小麦中国春和二倍体长穗偃麦草基因组DNA扩增筛选得到145条覆盖了长穗偃麦草所有7条染色体的特异ISSR、IRAP及REMAP标记。任意选择了60个特异片段，经扩增、克隆、测序。经与已知小麦序列进行比对，其中的34个片段的序列为长穗偃麦草特异性序列，根据其DNA序列设计新引物，将其中12个成功转化为长穗偃麦草染色体特异SCAR标记。结果表明根据ISSR、IRAP及REMAP技术发展的12个SCAR标记具有很好的稳定性与重复性，可用于小麦与长穗偃麦草远缘杂交后代中长穗偃麦草染色质的快速检测和特定染色体的快速跟踪检测。关键词：遗传学；长穗偃麦草；染色体特异分子标记；SCAR：Q37DevelopmentofchromosomespecificmolecularmarkersforThinopyrumelongatuminawheatbackgroundCHENShiqiang1,ZHUXue1,ZHANGChao1,CAOWenguang2,GeorgeFedak2,CHEN激anmin1(1.CollegeofBioscienceandBiotechnology,YangzhouUniversity,激angSuYangZhou225009;2.EasternCerealandOilseedResearchCentre,Ottawa,ON.Canada)Abstract:ElevenprimersweresynthesizedaccordingtothereversetranscriptaseandLTRconservedregionsofretrotransposonsBARE-1frombarleyandRIRE-1fromrice.Fifty-twopairsofprimercombinationsbasedonthese11primerswereusedforDNAamplificationofCS-Thinopyrumelongatumadditionlines,substitutionlinesplusthetwoparents.Itshowedthat145specificframentsofISSR,IRAPandREMAPwereobtainedwhichdistributedoverallthesevenEgenomechromosomesofThinopyrumelongatum.SixtyspecificfragmenrsofISSR,IRAPandREMAPwererandomlyselectedforcloningandsequencing.Thirty-foursequenceswerefoundnottobehomologouswithwheatsequencesinGenBank,whichwereconsideredtobethespecificsequencesofThinopyrumelongatum.Thirty-fourprimersacordingtothe34specificsequencesweresynthesized,and12chromosome-specificmarkersofThinopyrumelongatumwereobtainedwhichwerefurtherlyconvertedintoSCARmarkers.TheresultsindicatedthatISSR,IRAPandREMAPtechniquescanbeusedtodevelopchromosome-specificSCAR(sequence-characterizedamplifiedregions)markerswithgoodstabilityandrepeatability.ThesespecificSCARmarkerscannowbeusedtodetectandidentifyThinopyrumelongatumchromosomesinawheatbackgroundandpossiblyevensomeintrogressedsegments.Keywords:Genetics;Thinopyrumelongatum;Chromosome-specificmolecularmarkers;SCAR0引言随着小麦生产的发展和人们对小麦产量、品质、抗性的需求提高，仅靠小麦种属内的遗传资源已不能满足对小麦品种育种工作的需要。因此，从小麦近缘种中寻找优良基因并应用于小麦将显得尤为重要。偃麦草属中的长穗偃麦草（Thinopyrumelongatum）作为小麦的重---本文来源于网络，仅供参考，勿照抄，如有侵权请联系删除---作者简介：陈士强，（1981-），男，博士生，作物分子遗传学。通信联系人：陈建民，（1954-），男，教授，植物分子细胞遗传。jmchen@yzu.edu-1----本文来源于网络，仅供参考，勿照抄，如有侵权请联系删除---要近缘种，具有蛋白质含量高、抗多种病虫害、耐旱、耐寒等优异性状，可为小麦品种改良提供新的基因资源[1-3]。目前长穗偃麦草已成功与小麦杂交，为其抗逆、抗病虫害等优良基因向小麦基因组进行转移奠定了坚实的基础[4-7]。建立长穗偃麦草染色体特异分子标记，饱和辅助选择育种所需要的分子标记将为小麦抗50556065性育种提供理论基础。但由于长穗偃麦草的基因组序列信息已知的很少，给发展偃麦草特异分子标记带来了一定...