一、游戏一开始，玩家先选择男主角或者女主角，再替主角命名。开始的时候主角会在真新镇家中的二楼，走出门后，往真新镇上方草丛走，这时大木博士会出现，然后他就把你带回研究所，也会碰到你的宿敌小茂，大木博士会要你从小火龙、杰尼龟、妙娃种子三只里面选一只做为自己的神奇宝贝，选小火龙完后这时小茂很阴地选了乌龟，然后和你对战，打完后走出研究所，往北方的常磐市走。二、到了北方的常磐市后到这里的商店里，老板会给你东西要你转交给大木博士，这时再往南回真新镇，去拿给大木博士他就会给你神奇宝贝图鉴，然后到研究所上方的民房，里面是小茂的姊姊，和她说话她会给你地图喔。三、再往北到之前的常磐市，然后向西边的22号道路前进，这时会遇见小茂，要把等级练到大概十级左右就能轻易获胜，前下来再往前是往石英联盟的路，由于未收集到八家道馆徽章，所以无法进入，再回到常磐市之后发现这里的道馆无法进入，之好继续往北走，与途中的老伯谈话会教你捕捉神奇宝贝，然后他会送你一个教学电视，这是可以教玩家许多战斗中的基本常识的好道具喔，再往上走就能进入常磐森林。四、常磐森林内有许多的虫系神奇宝贝，这里也有道具可以捡，然后运气好的话可以遇到皮卡丘喔，之后你会到达尼比市。到达了尼比市之后可以去挑战道馆喔，这关道馆是以岩石系为主。尼比市道馆训练家--小刚使用的神奇宝贝--小拳石LV12/大岩蛇LV14打赢可得徽章，能提升神奇宝贝攻击力，战斗之外也可使用闪光，并且他会送你招式机34忍耐。五、道馆赛打赢后到尼比市最右方遇见一名博士，和他说话可获得跑步鞋（B+方向键就能在地图上跑步），尼比市最北方有个博物馆，进入要50元，进去可以参观参观古代神奇宝贝的化石，出尼比市往右边走，中途有些训练家，可以利用这个机会练等级，一直走之后会看见一个神奇宝贝中心，里面有人在卖鲤鱼王，一只要500元，其实以后会拿到钓竿就钓得到了，如果等不及了先买练也是不错选择，而神奇宝贝中心外面的右上就是月见山入口了喔。六、月见山里面都有一些不错的道具和招式机，如月之石和招式机46，而火箭队的一些手下也在这边，也会有许多训练家，到达最内侧后，有火箭队集团出没，之后打赢最里面的一个科学家，可以拿化石，只能选一个（左边是化石盔，右边是菊石兽，以后能到红莲岛那里让他们活过来），出了月见山洞窟，往右边走一点点会看到二个人，他们会教授你神奇宝贝招式（一个是百万吨铁拳，威力80、命中85、PP20，另一个是百万吨飞踢，威力120、命中75、PP5，玩家可要好好选择喔），再往右走就能到达华蓝市，接下来可以去挑战第二个道馆喔。华蓝市道馆训练家--小霞使用的神奇宝贝--海星星LV18/宝石海星LV21打赢可得徽章，能使等级30为止的神奇宝贝听话，在战斗以外可以使用居合斩，并且送你招式机03水之波动。七、在华蓝市神奇宝贝中心左边房子里，有一个老人想用迷唇姐和你交换蚊香蛙，华蓝市右上方的民房有一个人挡着让你进不去，接下来只好往华蓝市北边走，结果马上就会碰到小茂，打倒他之后可得到声音辨识器，可利用这个道具来探取一些游戏情报，之后继续往上走会有很多训练家，最后一位会送你金球（可卖钱），结果他竟然是火箭队的人，要你加入，当然主角不肯，之好和他打，打败他之后转右边的路走，走到底有一个房子，结果进入后发现一只皮皮，原来是正辉的机器让他自己变成这样，之后答应他帮他变回人类，帮他弄电脑之后他就回复了，之后他就会可以船票。八、回到华蓝市之前右上方有人挡住的屋子可以进入了，往他的后院走发现火箭队，打完后往下面的5号道路走，中途有饲育屋，可以饲养神奇宝贝但需要花钱，往下的城市入口目前进不去，只好往右边的地下通道走，一直走之后出去就能到达6号道路，往下就能走到枯叶市。九、到了枯叶市之后，在神奇宝贝中心左边的屋子，和他说话可得到破烂钓竿，在神奇宝贝中心内和柜台附近的女生说话，可以得到对战搜寻器，走路就能充电，充满之后在之前对战的训练家旁使用，只要他们有反应就能再和他们战斗，这样也可以练经验值和金钱，接下来到道馆上面的神奇宝贝俱乐部，听完会长的说话后可以拿自行车兑换卷，可以回到华蓝...