西瓜OSCA基因家族全基因组鉴定及胁迫响应分析摘要：【目的】ξ鞴OSCA基因家族进行成员鉴定、系统发育分析以及胁迫响应分析，为揭示西瓜OSCA基因生物学功能和抗逆分子机制提供参考依据。【方法】运用生物信息学的方法从西瓜全基因组数据库中鉴定出西瓜OSCA基因家族成员，根据染色体定位信息进行命名。对基因家族成员染色体位置、基因结构、共线性、启动子、蛋白结构和系统发育等进行全面分析。利用转录组数据和qRT-PCR分析西瓜OSCA基因在胁迫条件下的表达情况。【结果】西瓜OSCA基因家族有10个成员，不均等地分布在6条染色体上。西瓜OSCA蛋白分子量变化范围为24.59～91.97kD，氨基酸数量为214～809aa，多数定位于质膜上。共线性分析结果表明，西瓜OSCA基因在进化过程中发生了片段复制事件。西瓜OSCA基因家族分为三大类群，同一类群成员的外显子一内含子的组成模式、蛋白保守基序排列、蛋白二级结构数量比例和蛋白三级结构模型均相似。西瓜、水稻、番茄和拟南芥的OSCA基因被分为6个亚族，每个亚族均有西瓜OSCA基因分布。西瓜OSCA基因启动子区域含有厌氧诱导、冷胁迫应答、光反应和干旱胁迫应答等多种非生物胁迫响应元件。在干旱、低温和盐胁迫下，西瓜OSCA基因家族各成员表达量均有不同程度变化，其中ClaOSCA3和ClaOSCA5在3种不同胁迫条件下表达量均有显著差异（P0.05）。【结---本文来源于网络，仅供参考，勿照抄，如有侵权请联系删除---论】西瓜OSCA基因在进化过程中具有一定保守性，与拟南芥、水稻和番茄OSCA基因存在较近亲缘关系。西瓜OSCA基因家族内部存在功能分化，ClaOSCA3和ClaOSCA5可能是胁迫响应机制中的重要抗逆基因。关键词：西瓜;OSCA基因;胁迫响应;生物信息学：S651文献标志码：A：2095-1191（2021）12-3330-10Genome-wideidentificationandstressresponseanalysisofOSCAgenefamilyinwatermelonZHANGYu，WUCai-jun，SUWen-zhen，ZHOUCong，TENGLi-yao，TUZhi-wei，ZHUQiang-long*（CollegeofAgronomy，激angxiAgriculturalUniversity，Nanchang330045，China）Abstract：【Objective】Thememberidentification，phylogeneticanalysisandstressresponseanalysisofwatermelonOSCAgenefamilywerecarriedouttoprovidereferenceforrevealingthebiologicalfunctionandmolecularmechanismofstressresistanceofwatermelonOSCAgene.【Method】ThemembersofwatermelonOSCAgenefamilywereidentifiedbybioinformaticsmethodfromwatermelongenomedatabase，andnamedaccordingtochromosomelocationinformation.Chromosomeposition，genestructure，collinearity，promoter，proteinstructureandphylogenyofgenefamilymemberswereanalyzedcomprehensively.TranscriptomedataandqRT-PCRwereusedtoanalyzeOSCAgeneexpressioninwatermelonunde---本文来源于网络，仅供参考，勿照抄，如有侵权请联系删除---rstress.【Result】WatermelonOSCAgenefamilyhad10members，whichwereunevenlydistributedon6chromosomes.ThemolecularweightofwatermelonOSCAproteinvariedfrom24.59to91.97kD，andthenumberofaminoacidsrangedfrom214to809aa，mostofwhichwerelocatedintheplasmamembrane.TheresultsofcollinearityanalysisshowedthatthefragmentreplicationeventoccurredduringtheevolutionofwatermelonOSCAgene.ThewatermelonOSCAgenefamilywasdividedintothreegroups，andtheexon-introncompositionpattern，conservedmotifarrangementofprotein，thenumberproportionofsecondarystructureandthetertiarystructuremodelofthemembersofthesamegroupweresimilar.TheOSCAgenesofwatermelon，rice，tomatoandArabidopsisthalianaweredividedinto6subgroups，watermelonOSCAgenewasdistributedineachsubgroup.ThepromoterregionofOSCAgeneinwatermeloncontainedseveralabioticstressresponseelementssuchasanaerobicinduction，coldstressresponse，lightresponseanddroughtstressresponse.Underdrought，lowtemperatureandsaltstress，theexpressionlevelsofOSCAgenefamilymembersinwatermelonallchangedtodifferentdegrees，andtheexpressionlevelsofClaOSCA3andClaOSCA5allchangedsignificantlyunderthreedifferentstressconditions（P0.05）.【Conclusion】WatermelonOSCAgeneisconservedintheevolut---本文来源于网络，仅供参考，勿照抄，如有侵权请联系删除---ionaryprocess，andiscloselyrelatedtoOSCAgeneofA.thaliana，riceandtomato.FunctionaldifferentiationexistswithintheOSCAgenefamilyinwatermelon，andClaOSCA3andClaOSCA5maybeimportantstressresistancegenesinthestressresponsemechanism.---本文来源于网络，仅供参考，勿照抄，如有侵权请联系删除---