SAT2型口蹄疫分子病原学与分子流行病学研究进展李国秀丁耀忠李茜摘要口蹄疫是由口蹄疫病毒引起的一种人畜共患的高度接触性传染病。现已确定有7种病毒血清型，即O、A、C型，SAT1，SAT2，SAT3和Asia1型，SAT2至少由14个遗传拓扑型和3个血清亚型组成，SAT2主要流行于撒哈拉沙漠以南的非洲地区，主要感染野生动物尤其是非洲水牛，给发病地区的畜牧业带来了巨大的经济损失。主要从分子病原学和分子流行病学对SAT2口蹄疫研究情况进行综述，为SAT2型口蹄疫的防控提供了理论依据。关键词SAT2型口蹄疫;分子病原学;分子流行病学S85A0517-6611（2019）19-0004-03doi：10.3969/j.issn.0517-6611.2019.19.002开放科学（资源服务）标识码（OSID）：AbstractFootandmouthdiseaseisahighlycontagiousinfectiousdiseasecausedbyfootandmouthdiseasevirus.Sevenvirusserotypeshavebeenidentified，namely，O，A，C，SAT1，SAT2，SAT3andAsia1.SAT2consistsofatleast14genetictopologiesand3serumsubtypes.SAT2ismainlypopularinsubSaharanAfrica，mainlyinfectedwildanimalsespeciallyAfricanbuffalo.Itbroughthugelosstotheanimalhusbandryofepidemicarea.Therefore，thepapermainlyreviewedtheresearchonSAT2FMDfromtheaspectsofmolecularetiologyandmolecularepidemiology，andprovidedtheoreticalbasisforthepreventionandcontrolofSAT2FMD.KeywordsSAT2FMD;Molecularetiology;Molecularepidemiology口蹄疫（footandmouthdisease，FMD）是由口蹄疫病毒（footandmouthdiseasevirus，FMDV）引起的一种急性、烈性、高度接触性传染病。该病毒主要感染偶蹄兽，对畜牧养殖业及全球的国际贸易造成严重的经济损失，并且严重危害人类健康。国际兽疫局（OIE）将其定义为A类动物疾病之首，我国将口蹄疫列为一类传染病。FMDV有7种病毒血清型，即O、A、C、SAT1、SAT2、SAT3和Asia1，极易变异，但7种血清型之间几乎无交叉反应，即感染或接种一种血清型疫苗并不会对其他血清型产生免疫力。因此，必須对引起疫情的病毒进行分离，并对其进行特征描述，以便选择合适的疫苗[1-3]。口蹄疫病毒的7个血清型在全球流行范围并不均匀，其中南非型口蹄疫（southernAfricanterritoryfootandmouthdisease，SAT）主要在非洲和亚洲流行[4]，A和O在世界上广泛分布，Asia1型主要分布在亚洲。近年SAT2已经出现了跨境传播的危险，其已从撒哈拉沙漠以南经北非传至巴勒斯坦等国家，并在中东地区开始蔓延[5-6]，从而增大了我国暴发SAT2的风险。目前，我国在口蹄疫方面的研究只局限于O、A、C、Asia1型，缺乏对SAT2型口蹄疫的检测技术及疫苗的研究[7]。笔者主要针对SAT2型口蹄疫的分子病原学与流行病学进行综述，旨在为SAT2型口蹄疫的防控提供理论基础。1分子病原学1.1病毒基因组的结构南非型口蹄疫同其他FMD一样，同属于微RNA病毒科，口蹄疫病毒属，是单股正链小RNA病毒，完整的基因组RNA具有感染性，进入细胞之后可以复制出感染性病毒。基因组全长约有8500个核苷酸，分为3个主要区域：5UTR区、ORF区和3UTR区[8]。3末端连接多聚腺苷酸尾巴，并且FMDV基因组的3末端非翻译区在病毒复制中起着至关重要的作用，病毒poly（A）尾的茎环结构与其结合蛋白PABP作用后，病毒才开始启动转录与翻译[9]。5UTR长约1300个核苷酸，占全长基因组的12%，有多个“三叶草”二级结构，通过第一个核苷酸U与一个23～24个氨基酸组成的基因组连接蛋白VPg（3B）共价连接，5UTR能够稳定病毒基因组结构和调节病毒的生命周期[10]。ORF编码一个多聚蛋白，大约有7000nt，病毒蛋白酶将多聚蛋白切割成不同肽段，主要编码L蛋白、P1结构蛋白、P2和P3非结构蛋白。P1结构蛋白在后期的病毒翻译和修饰过程中被3Cpro蛋白酶裂解为3个主要的病毒结构蛋白VP0、VP1和VP3[11]。P2和P3在3C蛋白酶的作用下产生非结构蛋白2A、2B、2C、3A、3B、3C、3D。在病毒粒子的装配过程中，VP0、VP1和VP3先组装成5S聚集体再形成14S颗粒体，最后由12个14S颗粒体组装成75S病毒的空壳蛋白体[12]。1.2病毒形态结构特征电子显微镜观察，口蹄疫的病毒粒子呈圆形，表面光滑，直径为27～30nm，沉降系数为146S，...