荧光实时定量PCR研究GA负调控因子基因在棉花纤维不同发育时期的表达模式

荧光实时定量PCR研究GA负调控因子基因在棉花纤维不同发育时期的表达模式易小平++谢翔++廖文彬摘要棉花纤维发育经历起始期、延伸期、次级细胞壁加厚期、脱水期共4个发育时期。为了了解GA负调控因子基因在整个纤维发育时期的调节作用,采用敏感的实时定量PCR对GA负调控因子基因GhRGL在棉花纤维不同发育时期中的转录水平进行了定量研究,通过提取来源于不同纤维发育阶段[包括-3~0DPA(开花后)胚珠,3DPA胚珠,5DPA胚珠,10DPA胚珠,15DPA纤维,25DPA纤维]的样品总RNA,探讨不同发育时期GhRGL基因的表达模式。结果显示,GhRGL基因在所有被选的样品中都有表达,其中在5DPA胚珠和10DPA胚珠中转录水平较高,在10DPA胚珠中表达水平最高,在-3~0DPA胚珠、3DPA胚珠、15DPA纤维、25DPA纤维中的表达水平较低,表明GhRGL基因在纤维伸长期表达水平较高,暗示GhRGL可能对纤维伸长起着重要作用。關键词荧光实时定量PCR;棉花纤维发育;GA负调控因子基因;表达模式Q943.2ADoi:10.12008/j.issn.1009-2196.2017.10.009AnalysisoftheExpressionPatternofGAInsensitiveRegulatorGeneinCottonFiberDevelopmentbyRealtimePCRYIXiaopingXIEXiangLIAOWenbin(InstituteofTropicalBioscienceandBiotechnology,CATAS,Haikou,Hainan571101)AbstractCottonfibers,whicharehighlyelongatedepidermalcellsthatgrowfromtheseedintegument,undergoadevelopmentalprocessthatincludescellfatedetermination,initiation,elongation,specialization,andfinally,programmedcelldeath.TranscriptlevelsofGhRGLatdifferentstagesofcottonfiberdevelopmentwerequantifiedandanalyzedbysensitiveandreal-timePCRtechniquetounderstandtheexpressionpatternofGhRGLgeneatallstagesofcottonfiberdevelopment.TotalRNAsampleswereextractedfromdifferentstagesofcottonovulesandfibersincluding-3~0DPAovules,3DPAovules,5DPAovules,10DPAovules,15DPAfibers,and25DPAfiberstoanalyzetheexpressionpatternofGhRGLgeneincottonfiberdevelopment.TheresultsshowedthattheGhRGLgenewasexpressedinallselectedcottonsamples.HigherlevelsofGhRGLmRNAweredetectedin5DPAand10DPAovules,andtheh---本文来源于网络,仅供参考,勿照抄,如有侵权请联系删除---ighestlevelsofGhRGLmRNAweredetectedin10DPAovules.LowerlevelsofmRNAweredetectedin-3~0DPAovules,3DPAovulesand15DPAfibers,and25DPAfibers.genewasexpressedatthehighestlevelsatthefiberelongationstage,suggestingtheimportantroleofGhRGLincottonfiberelongation.KeywordsrealtimePCR;cottonfiberdevelopment;GAinsensitiveregulatorgene;expressionpatternGA信号转导途径是通过DELLA蛋白来抑止的。所有的DELLA蛋白都具有以下特征:在N端有高度保守的DELLA结构域和VHYNP结构域[1-2]。在拟南芥基因组中,共有5个高度同源的DELLA蛋白抑止子,包括GAINSENSITIVE(GAI)、REPRESSOROFga1-3(RGA)、RGL1(RGA-LIKE1)、RGL2、RGL3[2-3]。GAI和RGA在抑制植物延伸生长时具有重叠的功能,RGA-LIKE1(RGL1)和RGL2分别在控制植物发芽和花发育中起着重要作用[4-5]。所有的DELLA蛋白均可以通过泛素降解系统进行降解,而不能对GA反应进行抑制[6-7]。棉花纤维是生长于种子表面的高度延伸的表皮细胞,经历了细胞命运决定期、起始期、延伸期、次级细胞壁加厚期,最终经脱水期后细胞程序死亡[8]。棉花纤维发育至少有一部分是由植物激素控制的[9]。通过胚珠液体体外培养对棉花纤维发育进行分析可知,外源IAA与GA是棉花纤维发育所必需的。笔者前期研究表明,使用GA生物合成抑制剂可抑制棉花纤维的生长,说明GA在启动棉花纤维伸长中起着重要作用。因此,在前期的研究中,对GA负调控因子基因DELLA基因进行分离研究,对分离的棉花DELLA蛋白进行生物信息学分析,结果显示,该蛋白具有与拟南芥中DELLA蛋白一样的保守结构域。本研究运用QPCR对DELLA蛋白编码基因GhRGL在棉花纤维发育各个时期的表达模式进行了研究。endprint1材料与方法1.1材...

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