矮牵牛B-bo型锌指蛋白基因PhBB8的克隆与表达分析

园艺学报,():–2014411224372445wwahs.acActaHorticulturaeSinicaE-mail:yuanyixuebao@126收稿日期:2014–07–31;修回日期:2014–12–08基金项目:国家自然科学基金项目(31101576);中央高校基本科研业务费专项基金项目(2013PY090);教育部高等学校博士学科点专项科研基金项目(20110146120040)矮牵牛B-box型锌指蛋白基因PhBBX8的克隆与表达分析宁露云,李蓓,李佩,包满珠,张蔚*(华中农业大学园艺林学学院,园艺植物生物学教育部重点实验室,武汉430070)摘要:利用矮牵牛(Petuniahybrida)基因表达谱芯片筛选出应答低温胁迫的相关基因,从中发现1个B-box型锌指蛋白基因PhBBX8。通过RT-PCR克隆得到该基因的编码区序列(CDS),为1242bp,预测其编码氨基酸413aa,N端含有2个B-box盒,C端含有1个CCT结构域。系统进化树分析发现,PhBBX8与拟南芥AtBBX8等聚类为一支。利用半定量RT-PCR检测其在根、茎、叶和花中的表达特性,结果表明该基因在花中表达量较高,其次为根,而在茎和叶中表达较弱;利用实时定量PCR检测了在低温、干旱、ABA、MeJA、高盐和高渗胁迫处理下矮牵牛叶片中PhBBX8的诱导表达情况,结果表明,PhBBX8表现出不同程度的上调,其中除干旱胁迫外,其他胁迫下上调倍数都较高,初步推测该基因与矮牵牛应答低温等非生物逆境相关。关键词:矮牵牛;B-box;锌指蛋白;非生物逆境;表达分析:S681.9文献标志码:A:0513-353X(2014)12-2437-09CloningandExpressionAnalysisofaB-box-typeZinc-fingerProteinGenePhBBX8inPetuniahybridaNINGLu-yun,LIBei,LIPei,BAOMan-zhu,andZHANGWei*(KeyLaboratoryofHorticulturalPlantBiology(MinistryofEducation),CollegeofHorticultureForestrySciences,HuazhongAgriculturalUniversity,Wuhan430070,China)Abstract:Geneexpressionmicroarrayofpetuniawasappliedtoselectcoldresponsivegene,fromwhichaB-box-typezinc-fingerproteingenePhBBX8wasdiscovered.ThefulllengthofthecodingregionofPhBBX8amplifiedbyRT-PCRwas1242bp,andtheproductofPhBBX8genewaspredictedtoconsistof413aminoacidresidualscontainingtwoB-boxdomainsattheN-terminalandoneCCTdomainattheC-terminal.ThephylogenetictreeanalysesshowedthatPhBBX8---本文于网络,仅供参考,勿照抄,如有侵权请联系删除---wasclusteredinthesamebranchwithAtBBX8inArabidopsis.Bysemi-quantitativeRT-PCR,PhBBX8wasfoundtoexpressdifferentiallyinallthetissuesdetected,includingroot,stem,leafandflower.Stressinducedexpressionanalysisbyreal-timequantitativePCRshowedthattheexpressionofPhBBX8couldbeinducednotonlybycold,butalsobydrought,ABA,MeJA,saltandhypertonicstressesindifferentdegrees,suggestingPhBBX8genewasassociatedwiththeresponsesofcoldandotherabioticstresses.*通信作者Authorforcorrespondence(E-mail:zhangw@mail.hzau.edu)---本文于网络,仅供参考,勿照抄,如有侵权请联系删除---2438园艺学报41卷Keywords:Petuniahybrida;B-box;zinc-fingerprotein;abioticstress;expressionanalysis锌指蛋白最早是在1985年由Miller等(1985)在非洲爪蟾卵母细胞转录因子TFⅢA中发现,随后陆续在包括人类(Bondetal.,2004;Jonesetal.,2006)的哺乳动物、植物、果蝇(Liangetal.,2008)、酵母(Mazauricetal.,2010)和病毒(Morelletetal.,2006)中鉴定出大量的锌指蛋白。Berg(1993)根据锌指蛋白序列与功能的不同将其分为9大类:C2H2、C8、C6、C3HC4、C2HC、C2HC5、C4、C4HC3和CCCH(C和H分别代表半胱氨酸和组氨酸)。Iuchi(2001)对目前所发现的锌指蛋白结构进行分析,结果表明,大部分锌指蛋白都属于C2H2型。还有一些转录因子虽然不含有经典的锌指结构域,但含有类似的锌指结构域。Greb等(2007)发现PHD锌指结构域能够特异性识别并结合组蛋白H3K4的甲基化密码(修饰),发挥基因转录调控功能,参与植物多种生长发育以及非生物逆境胁迫响应等过程。B-box蛋白...

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