蓖麻基因组mlo基因家族成员的鉴定及其序列特征分析覃碧

中国农学通报2014,30(15):268-273ChineseAgriculturalScienceBulletin艷麻基因组Mio基因家族成员的鉴定及其序列特征分析票碧I,土萌2,刘巧玲3,张宇2(冲国热帯农业科学院橡胶研究所农业部橡胶树生物学少遗传资源利用重点实验室,海南傑州571737;2海南人学环境与植物保护学院,海口570228;3海南人学应用科技学院,海南脩州571737)摘要:Mio因家族是一类重要的植物抗病基因,而龍麻基因组MIO成员的鉴定和分析为进一步培育菌麻抗病品种奠定基础。木研究通过系统地分析蒐麻基因组数据,从中共鉴定出16个Mio成员,其中15个具冇完整的ORF,1个序列缺失。对15个具冇完整ORF的萬麻Mio基因进行结构分析发现,它们在序列长度上差异较大,但其编码蛋白均具有一个保守的Mio结构域和6~7次跨膜结构,主耍定位在细胞膜上。对蒐麻Mio基因与其他物种的Mio基因进行聚类关系分析,结果显示,可将萬麻Mio基因家族分为7类(I~vn),其中第vn类只包含2个蒐麻Mio基因(RcMloS和RcMlo9)t这nJ能是蒐麻中特有的淡Mio;菌麻RcMlo3、RcWo2、RcMlo6和RcMlol2与已知的抗病Mio基因分别聚在第IV和第V类,这4个基因可能是蒐麻基因组中貝-有抗病功能的Mio。本研究结果为进…步克隆茁麻Mio基因并研究其功能奠定了良好的基础。关键词:麓麻;基因组;Mio;基因家族;序列分析:S5文献标志码:A论文编号:2013-2312IdentificationandSequenceCharacterizationofMioGeneFamilyfromtheGenomeofRiciunscommunisL.QinBi-WangMeng?,LiuQiaoling?,ZhangYu>(iKeyLaboratotyofBiologyandGeneticResourcesofRubberTree,MinistryofAgriculture.RubberResearchInstitute.ChineseAcademyofTropicalAgriculturalSciences.DanzhouHainan571737;2EnvironmeniandPlantProtectionColleyHainanUniversity,Haikou570228;CollegeofAppliedScienceandTechnologyofHainanUniversity^DanzhouHainan571737)Abstract:Miogenefamilyisanimportantclassofplantdiseasesresistancegenes・IdentificationandsequencecharacterizationofMiogenesfromthegenomeofcastor(RiciunscommunisL.)willlaythefoundationforbreedingfordiseaseresistantvarietiesincastor・BasedonsystematicanalysisofthegenomesequenceofRiciunscommunis,atotalof16Miogeneswereidentifiedinthisstudy,ofwhich15containedacompleteORFandonepartialsequence・Sequenceanalysisrevealedthatgreatdifferencewereobservedinthesizesofthe15geneswithcompleteORF,howeveraconservedMiodomainand6to7transmembranedomainswerefoundintheircorrespondingproteinsequences.ThesecastorMioproteinsweremainlylocatedinplasmamembrane・PhylogeneticanalysiswasperformedtorevealtheevolutionofthecastorMiogeneswithcompleteORF,andMiogenesfromotherspecies・TheresultindicatedthatthecastorMiofamilycouldbedevidedinto7clades(I-VII).TheVIIcladecontainedonlytwocastorMiogenes(RcMlo8andKcMlo9).whichsuggestedthatit基金项山国家口然科学埜金“泛素连接酶HbAPCIO调控大然橡胶生物合成的作用机w1300503):紆南省口然科学基釘橡胶树乙烯利响应相关E3泛奈连接酶赧囚的.克降及其功能研究"313064):农业部热作专项“橡胶树•病山害监测防控技术研究"I2RZBC.11)。第一作者简介:草豹,女,1982年出生,广西人,助理研究员,噂士,研究方向为分子生物学。通信地址:571737海南省傑州市士册新村中国热常农业科学院橡胶硏究所,Tel:0898-23301174,E-mail:qinbil26@163。通讯作者:张宇,女,1974年出牛.,河北昌黎人,副教授,研究方向为农药学。通信地址:570228海南省海II市人民大道58号海南大学坏境与梢物保护学院,Tel:0898-66192915rE-niail:yuzh(mgLniin@163。收稿日期:2013-08-30,修冋日期:2013・10・30。0引言朗麻(RiciunscommunisL.)是•种人戟科(Euphorbiaceae)M麻属(Riciuns)一年或多年生双了叶植物,广泛生长在热带、亚热带和温带地区,是世界十大重耍油料作物之一卩蒐麻油是生产高级润滑油、化妆品、化工和医药产品的重耍原料,也可生产生物柴油,其综合开发利用的经济价值极高...

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