全血PCR直接扩增技术在亚甲基四氢叶酸还原酶基因C677T多态性分析中的应用

全血PCR直接扩增技术在亚甲基四氢叶酸还原酶基因C677T多态性分析中的应用全血PCR直接扩增技术在亚甲基四氢叶酸还原酶基因C677T多态性分析中的应用刘冉1,尹立红1*,浦跃朴1,周国华2,王仪3,潘恩春3,杨文洲3摘要:[目的]应用全血PCR直接扩增技术检测淮安汉族人群亚甲基四氢叶酸还原酶基因MTHFRC677T多态性并分析其地理分布特征,评价该技术在大规模现场人群基因多态性筛检中的应用价值。[方法]应用全血PCR直接扩增技术分析205例淮安汉族健康个体MTHFRC677T的基因型分布频率,并与传统的聚合酶链反应—限制性片段长度多态性(Polymerasechainreactionandrestrictionfragmentlengthpolymorphism,PCR-RFLP)技术检测结果进行比对。并将检测结果与已报道的不同地区汉族人群资料进行比较。[结果]全血PCR直接扩增技术与传统PCR-RFLP法测定MTHFRC677T多态性的分布频率具有高度一致性(Kappa=0.946,95%CI:0.906~0.1015)。结果表明淮安汉族人群MTHFRC677T的基因型频率分别为CC32.68%、CT46.83%、TT20.49%;C和T等位基因频率分别为56.10%和43.90%;结合其他9个地区的汉族人群MTHFR677T等位基因频率的趋势性χ2检验,发现MTHFR677T的分布随地理纬度的降低,T等位基因频率也降低(P=0.001)。[结论]全血PCR直接扩增技术简便易行,适用于人群基因多态性的快速筛检。在所研究的10个中国汉族人群中MTHFRC677T多态性显示与不同地理纬度的地区分布有统计学相关性。关键词:外周血;亚甲基四氢叶酸还原酶;单核苷酸多态;筛检技术MTHFRC677TPolymorphismRapidlyDetectedwithDirectAmpli?cationProtocolinPeripheralBloodSamplesLIURan1,YINLi-hong12*,PUYue-pu1,ZHOUGuo-hua2,WANGYi3,PANEn-chun3,YANGWen-zhou3(1.SchoolofPublicHealth,SoutheastUniversity,JiangsuNanjing210109,China;2.HuadongResearchInstituteforMedicineandBiotechnics,JiangsuNanjing210102,China;3.HuaianCenterforDiseaseControlandPrevention,JiangsuHuaian223001,China)Abstract:[Objective]Toexaminethefrequencydistributionofmethylenetetrahydrofolatereductase(MTHFR)C677TpolymorphismsinHuaianHanpopulationandtoevaluatetheapplicationofDirectAmplificationProtocolfordetectinggeneticpolymorphismsinpopulation.[Methods]PolymorphismsofMTHFRC677Tin205HuaianHanhealthyvolunteerswasdetectedwithDirectAmplificationProtocolandRFLPtechnique,respectively.ThefrequencyofMTHFRC677TgenetypeswascomparedwithotherHanpopulationdatafromdifferentareasinChina.[Results]TherewashighconsistencyofMTHFRC677TpolymorphismsbetweenthemethodwithbloodsampleandwithgenomicDNA(Kappa=0.946,95%CI0.906~0.1015).ThefrequenciesoftheC/C,C/TandT/Tgenotypesinthesubjectswere32.68%、46.83%and20.49%respectively,andtheallelefrequenciesof677Cand677Twere56.10%and43.90%respectively.TheanalysisofMTHFR677TallelefrequencywithHanpopulationinotherninedifferentareasinChinashowedthedistributionofMTHFR677Twasdecreasedwithgeographicallatitude(P=0.001).[Conclusion]ThefrequencyofthegeneticpolymorphismsofMTHFRC677TinChineseHanpopulationsfromdifferentareasdependsongeographicallatitude.TheMTHFRC677TdistributionofHuaianHanpopulationgroupisconsistentwiththemodelofpopulationgroupswiththelatituderangebetweenN30°andN35°.DirectAmplificationProtocolinperipheralbloodsamplesisagoodsystemofdirectPCRamplificationwithbloodsampleforrapididentificationofgeneticpolymorphisms.KeyWords:peripheralblood;methylenetetrahydrofolatereductase;singlenucleotidepolymorphism;screening基金项目:国家自然科学基金资助项目(编号:30571540,30671732)作者简介:刘冉(1974-),女,博士生,研究方向:肿瘤环境基因组学*通讯作者(Correspondentauthor):尹立红教授,E-mail:lhyin@https://www.sodocs.net/doc/5d16659507.h...

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