今天接着看paper,突然想把以前的ChlP-Seq工作总结一下。ChlP-Seq前期或者基本的dataanalysis主要分两部分一是readsalignment,因为测序得到的read序列并不知道其在对应genome上的位置，也就是说不知道测序iT）来的read定位在genome±的什么地方，因此，首先得用alignmenttool把这些readmap到基因组上。那是不是一般blast软件都可以完成了？答案是否定的。read数目非常多，都是按照million数量级计算，并且长度短，一般为20〜3Obp...
