全球首次完成杨树全基因组测序由美国能源部启动并实施的杨树全基因组测序计划已圆满完成，并于2004年9月21日对公众开放了全序列数据库。南京林业大学科研人员尹佟明副教授参与了此项研究。杨树基因组的新闻发布及庆祝会定于12月6日在美国加州举行。该项研究可望使杨树这一重要树种的品种改良时间大大缩短，用区区几十年跨越千年关。研究的完成，使杨树成为继拟南芥和水稻之后，第三个测定全序列的植物，并且是第一个测定全基因...
Nature：高粱基因组完成测序2009年1月29日本期Nature发表了高粱（Sorghumbicolour）的基因组序列。高粱基因组-美国科学家完成测序美国能源部联合基因组研究所等机构的科学家日前完成了高粱的全基因组测序和分析，相关研究成果已刊登在２９日出版的《自然》杂志上。科学家利用全基因组鸟枪测序法完成了对高粱基因组的测序。结果显示，高粱基因组大约有３万个基因，有７．３亿个核苷酸，比大米约多７５％。科学家以及工业界人士认...
二代测序技术在血液肿瘤中的应用中国专家共识(2022年版)血液肿瘤是一类具有高度异质性的疾病，其诊疗需要结合形态学、免疫学、遗传学和分子生物学进行综合分析。二代测序（Next-generationsequencing,NGS）作为新的分子生物学技术，具有通量高、灵敏度高、成本低等优势，是探索血液肿瘤的分子发病机制并指导临床诊疗的重要手段。为推动NGS在血液肿瘤诊疗中的应用，提高诊疗水平，中国抗癌协会血液肿瘤专业委员会、...
Invitrogen中国测序通用引物序列引物名称序列(5-3)M13RCAGGAAACAGCTATGACCM13FTGTAAAACGACGGCCAGTM13F(-47)CGCCAGGGTTTTCCCAGTCACGACM13R(-48)AGCGGATAACAATTTCACACAGGAM13(-96)CCCTCATAGTTAGCGTAACGSP6ATTTAGGTGACACTATAGT7TAATACGACTCACTATAGGGT7terminatorTGCTAGTTATTGCTCAGCGGT3ATTAACCCTCACTAAAGGGApGEX-4T-5GGGCTGGCAAGCCACGTTTGGTGpGEX-4T-3CCGGGAGCTGCATGTGTCAGAGGGLp1TGTATCTTATGGTACTGTAACTGGLp2CTTTATGT...
焦磷酸测序检测慢性乙型肝病患者血清HBVP基因变异的临床价值刘先进吴月平(南通市第三人民医院江苏南通226006)【摘要】目的探讨核苷类药治疗不同时间段慢性乙型肝病患者血清乙型肝炎病毒聚合酶(HBVP)棊因焦磷酸测序结果的临床价值。方法运用焦磷酸测序仪器配套的软件AssayDesignSW在目的区域两端保守区域设计PCR引物及测序引物，采用套式PCR方法检测血清屮HBVDNA,按照PyroMarkID遗传分析系统用SNP模式进行PCR产物HBV相关位点的焦...
焦磷酸测序定量检测宫颈组织LMX1A基因甲基化水平的临床意义王立锋1朱昊平2夏子茵1徐军1通讯作者1.上海市闵行区屮心医院妇产科上海201199；2.上海市计划生育科学研究所上海200032【摘要】目的：检测LIM同源盒转录因子X基因(LMX1A)基因在不同程度病变组屮宫颈组织屮的甲基化水平，评估其作为宫颈上皮细胞癌变的分子标志物的诊断价值。方法：使用焦磷酸测序法检测每个抑癌基因的甲基化情况。比较正常组织和不同程度病变组织的甲基...
克氏原螯虾养殖群体的SLAF测序及遗传多样性分析摘要：【目的】探究克氏原螯r养殖群体内和群体间的遗传多样性，为引种和群体间杂交以改善养殖群体种质提供参考依据。【方法】以湖北、江西、安徽、浙江和江苏5省克氏原螯虾主产地14个养殖群体的120个个体为研究对象，采用简化基因组测序技术――特定区点扩增片段测序技术（SLAF-seq）进行基因组测序，获得基因组SNP基因型数据，构建群体系统发育进化树，并进行群体结构、主成分和...
一株猪丹毒丝菌的全基因组测序及SpaA基因分析彭凌林锦铨李玲慧刘博婷蔡巩林摘要：本研究测定猪丹毒丝菌临床毒株SG7的全基因组序列，并运用生物信息学方法对测定的全基因组序列及猪丹毒丝菌表面保护性抗原A基因（SpaA）进行分析。SG7菌株的基因组全长为1834291.00bp，G+C含量为36.3%，基因总数1846个。将SG7菌株与GenBank中8条完整的猪丹毒丝菌全基因组序列进行比较，发现国内外不同菌株间基因组的基本信息存在不同程度差异。基...
焦磷酸测序检测CYP2C19基因多态性方法的建立[摘要]目的建立一种基于焦磷酸测序技术的用于CYP2C19基因多态性快速检测的方法。方法选择2016年12月～2017年3月于贵州省人民医院行健康体检者50名，提取其基因组DNA，针对CYP2C19*2（681G>A）、CYP2C19*3（636G>A）、CYP2C19*17（-806C>T）3个单核苷酸多态性（SNP）位点分别设计一套PCR扩增引物和焦磷酸测序引物。将PCR扩增产物制备成单链测序模板，用QiagenPyroMarkQ24焦磷酸测序仪...
小鼠B7-2基因的克隆、测序及其重组质粒的构建杨建征，金光辉，田梅，潘雪娜，金顺子，刘树铮*（吉林大学卫生部放射生物学重点实验室，吉林长春）[摘要]目的：克隆小鼠B7-2基因编码区的cDNA序列，并构建其表达载体。方法：利用逆转录多聚酶链反应（RT-PCR）法，以小鼠脾细胞mRNA为模板，扩增获得B7-2基因，与pMD-18T连接作全自动测序，并利用基因重组技术构建包含B7-2的表达质粒pcDNA3.1-CMV-B7-2及pcDNA3.1-Egr-B7-2。结果：经...
中国二代测序服务公司一览表早在DNA双螺旋结构（WatsonandCrick,1953）被发现后不久就有人报道过DNA测序技术，但是当时的操作流程复杂，没能形成规模。随后在1977年Sanger发明了具有里程碑意义的末端终止测序法，同年A.M.Maxam和Gilbert发明了化学降解法。Sanger法因为既简便又快速，并经过后续的不断改良，成为了迄今为止DNA测序的主流。然而随着科学的发展，传统的Sanger测序已经不能完全满足研究的需要，对模式...
新一代高通量RNA测序数据的处理与分析*王曦1汪小我1王立坤1,2冯智星1张学工1**(1生物信息学教育部重点实验室,清华信息科学与技术国家实验室(筹生物信息学研究部,清华大学自动化系,北京100084;2吉林大学计算机科学与技术学院,长春130012摘要随着新一代高通量DNA测序技术的快速发展,RNA测序(RNA-seq已成为基因表达和转录组分析新的重要手段.RNA-seq技术产生的海量数据为生物信息学带来了新的机遇和挑战.有效地对测序数据进行针对...
新一代高通量RNA测序数据的处理与分析*王曦1汪小我1王立坤1,2冯智星1张学工1**(1生物信息学教育部重点实验室,清华信息科学与技术国家实验室(筹生物信息学研究部,清华大学自动化系,北京100084;2吉林大学计算机科学与技术学院,长春130012摘要随着新一代高通量DNA测序技术的快速发展,RNA测序(RNA-seq已成为基因表达和转录组分析新的重要手段.RNA-seq技术产生的海量数据为生物信息学带来了新的机遇和挑战.有效地对测序数据进行针对...
